217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_13445 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_13445  predicted protein  100 
 
 		 164 aa  338  2e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11830  predicted protein  49.07 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_16545  predicted protein  46.99 
 
 		 167 aa  138  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335884  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34527  predicted protein  41.14 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.335485 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29913  predicted protein  42.17 
 
 		 217 aa  125  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8112  predicted protein  66.23 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.371613  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10666  predicted protein  54.9 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_8479  predicted protein  46.15 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013168  normal  0.105392 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01530  tRNA binding protein, putative  37.93 
 
 		 362 aa  102  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_8313  predicted protein  38.41 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.105668  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65359  G4 quadruplex nucleic acid binding protein  41.01 
 
 		 381 aa  90.9  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30537  predicted protein  37.59 
 
 		 221 aa  86.3  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.833687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28697  predicted protein  34.23 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.869582  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1063  methionyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 793 aa  77.8  0.00000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10474  cofactor for methionyl-and glutamyl-tRNA synthetases, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15940)  29.85 
 
 		 438 aa  75.1  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.134683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 642 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 663 aa  72  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 670 aa  70.9  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1003  hypothetical protein  41.38 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 654 aa  67.8  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002668  tRNA-binding protein YgjH  40.23 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 657 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4388  hypothetical protein  41.38 
 
 		 110 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.83427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 		 664 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0626  hypothetical protein  41.38 
 
 		 110 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3541  hypothetical protein  41.38 
 
 		 110 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3368  hypothetical protein  41.38 
 
 		 110 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3256  hypothetical protein  41.38 
 
 		 110 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02943  hypothetical protein  40.23 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0627  t-RNA-binding domain protein  40.23 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02893  hypothetical protein  40.23 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 648 aa  65.5  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 650 aa  65.5  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 		 648 aa  65.1  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0600  methionyl-tRNA synthetase  30.58 
 
 		 734 aa  61.6  0.000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.801197  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  31.78 
 
 		 734 aa  62  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1914  hypothetical protein  36.84 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  30.39 
 
 		 672 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1314  methionyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 694 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2642  methionyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 694 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0566418  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2546  methionyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 694 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.493596  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 647 aa  58.9  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0003  t-RNA-binding domain protein  37.5 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 		 682 aa  58.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1350  methionyl-tRNA synthetase  36 
 
 		 628 aa  58.2  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019937  normal  0.216507 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 		 710 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 663 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 663 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  31.52 
 
 		 691 aa  57  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1814  methionyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 642 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 654 aa  56.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 663 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 		 640 aa  55.1  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0154  methionyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 636 aa  55.1  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1976  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.66 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0727  methionyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 		 638 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.163766  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03321  hypothetical protein  36.62 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  33.01 
 
 		 711 aa  54.3  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 		 693 aa  54.3  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1432  methionyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 		 700 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.111821  normal  0.539533 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  32.22 
 
 		 655 aa  53.9  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1689  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.36 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 634 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  31.58 
 
 		 642 aa  53.1  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0717  methionyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 679 aa  53.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.638395  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0315  methionyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 648 aa  52.4  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 		 699 aa  52  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 		 673 aa  51.2  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  35.06 
 
 		 653 aa  51.2  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1936  methionyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 		 684 aa  51.2  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0206169  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 		 650 aa  50.8  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 		 632 aa  51.2  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 		 688 aa  50.8  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  31.73 
 
 		 690 aa  50.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 629 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 		 663 aa  50.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 629 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  29.49 
 
 		 628 aa  49.7  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1065  methionyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 		 644 aa  49.7  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.241007  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 690 aa  49.7  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1596  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 700 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0255918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  32.47 
 
 		 671 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0796  methionyl-tRNA synthetase  36 
 
 		 632 aa  49.7  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.000000000458098  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2914  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 697 aa  48.9  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.743177  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 		 651 aa  49.3  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 645 aa  48.9  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1746  methionyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 675 aa  48.9  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 680 aa  48.5  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0709  methionyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 		 725 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24373  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1211  methionyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 		 725 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0856  methionyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 		 770 aa  48.5  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2191  methionyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 		 726 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00221982  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0103  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  43.48 
 
 		 115 aa  48.5  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226267  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2304  methionyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 		 717 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2982  methionyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 		 717 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.326883  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1052  methionyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 		 717 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1057  methionyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 		 725 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1617  methionyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 		 717 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0857  methionyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 		 722 aa  48.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000674462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2437  methionyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 		 718 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>