241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_13265 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1969  magnesium chelatase, H subunit  32.72 
 
 
1268 aa  697    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.291202  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2581  magnesium chelatase, H subunit  32.38 
 
 
1267 aa  688    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2205  magnesium chelatase, H subunit  31.92 
 
 
1269 aa  668    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2767  magnesium chelatase, H subunit  32.69 
 
 
1251 aa  649    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0380  magnesium chelatase subunit H  61.13 
 
 
1337 aa  1728    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.582588  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0542  magnesium chelatase subunit H  63.88 
 
 
1329 aa  1816    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1974  magnesium chelatase subunit H  37.84 
 
 
1277 aa  901    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.44138  normal  0.650395 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4382  magnesium chelatase subunit H  63.32 
 
 
1330 aa  1806    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0354269  unclonable  0.0000000162582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3311  magnesium chelatase subunit H  64.4 
 
 
1328 aa  1841    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0712656  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1436  magnesium chelatase subunit H  63.2 
 
 
1333 aa  1812    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0253  magnesium chelatase subunit H  37.32 
 
 
1296 aa  861    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0255  magnesium-chelatase, subunit H  33.28 
 
 
1267 aa  683    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.409293  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0787  magnesium-chelatase, subunit H  32.49 
 
 
1275 aa  689    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0827  magnesium chelatase subunit H  61.9 
 
 
1336 aa  1732    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.458229  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1542  magnesium chelatase subunit H  38.12 
 
 
1283 aa  889    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0156195 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0227  magnesium-chelatase, subunit H  31.98 
 
 
1266 aa  674    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0983  magnesium-chelatase, subunit H  33.23 
 
 
1274 aa  706    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.13012  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1828  magnesium chelatase subunit H  62.2 
 
 
1341 aa  1755    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0969  magnesium chelatase subunit H  61.13 
 
 
1336 aa  1719    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.72358  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2137  magnesium chelatase subunit H  63.91 
 
 
1328 aa  1779    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67414  normal  0.220036 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0621  magnesium chelatase subunit H  35.65 
 
 
1242 aa  815    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1436  magnesium chelatase, H subunit  32.04 
 
 
1273 aa  673    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.958872  normal  0.470699 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2583  magnesium chelatase subunit H  39.01 
 
 
1276 aa  880    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1048  magnesium chelatase, H subunit  32.1 
 
 
1273 aa  689    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.115422 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10391  magnesium chelatase subunit H  61.13 
 
 
1336 aa  1723    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45384  predicted protein  63.47 
 
 
1336 aa  1740    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00403917  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1286  magnesium chelatase subunit H  37.98 
 
 
1245 aa  875    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2525  magnesium chelatase, H subunit  33.82 
 
 
1250 aa  672    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0401032  normal  0.169261 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4320  magnesium chelatase subunit H  63.32 
 
 
1330 aa  1806    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  63.77 
 
 
1330 aa  1825    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3224  magnesium chelatase subunit H  64.17 
 
 
1329 aa  1829    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335688  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1794  magnesium chelatase, H subunit  31.72 
 
 
1280 aa  685    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0575  magnesium chelatase subunit H  40.73 
 
 
1261 aa  935    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.486598  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1904  magnesium chelatase subunit H  38.64 
 
 
1300 aa  912    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.886587  hitchhiker  0.00767662 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1629  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.52 
 
 
1217 aa  689    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.12065  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2311  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  32.3 
 
 
1267 aa  689    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0576549  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2313  magnesium chelatase subunit H  38.87 
 
 
1280 aa  899    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.227172  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0239  magnesium chelatase, H subunit  35.75 
 
 
1269 aa  728    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.940988  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1635  magnesium chelatase subunit H  36.91 
 
 
1249 aa  800    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.28996  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10391  magnesium chelatase subunit H  61.42 
 
 
1336 aa  1728    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09061  magnesium chelatase subunit H  61.52 
 
 
1335 aa  1722    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10621  magnesium chelatase subunit H  61.21 
 
 
1337 aa  1729    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13931  magnesium chelatase subunit H  61.2 
 
 
1347 aa  1705    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0983258 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09361  magnesium chelatase subunit H  61.36 
 
 
1339 aa  1736    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360332 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2154  magnesium chelatase, H subunit  32.3 
 
 
1267 aa  678    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2207  magnesium chelatase subunit H  39.11 
 
 
1277 aa  925    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2156  magnesium chelatase subunit H  38.37 
 
 
1277 aa  903    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.992629  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13265  protoporphyrin IX magnesium chelatase, subunit H  100 
 
 
1343 aa  2768    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_56602  predicted protein  31.78 
 
 
1479 aa  609  9.999999999999999e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678567  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  32.64 
 
 
1187 aa  527  1e-148  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  32.15 
 
 
1187 aa  524  1e-147  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3536  magnesium chelatase subunit H  37.4 
 
 
1194 aa  519  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1771  cobaltochelatase subunit CobN  29.35 
 
 
1343 aa  516  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163457  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1008  magnesium chelatase subunit H  36.83 
 
 
1193 aa  516  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.256622 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0287  magnesium chelatase subunit H  36.26 
 
 
1193 aa  515  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1930  magnesium chelatase subunit H  36.26 
 
 
1193 aa  515  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.358411 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3979  magnesium chelatase subunit H  36.06 
 
 
1248 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426085  normal  0.16908 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1732  magnesium chelatase subunit H  35.47 
 
 
1248 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3734  magnesium chelatase subunit H  36.06 
 
 
1248 aa  509  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0107251 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3099  cobaltochelatase  29.82 
 
 
1243 aa  506  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.723092 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  31.25 
 
 
1259 aa  504  1e-141  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6415  magnesium chelatase subunit H  35.47 
 
 
1197 aa  504  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5281  magnesium chelatase subunit H  36.63 
 
 
1238 aa  503  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.234603  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0159  magnesium chelatase subunit H  37.9 
 
 
1173 aa  500  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.971256  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1315  magnesium chelatase subunit H  35.29 
 
 
1247 aa  503  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2040  magnesium chelatase subunit H  34.48 
 
 
1249 aa  499  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328237 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  29.65 
 
 
1244 aa  499  1e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  30.47 
 
 
1266 aa  498  1e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  30.84 
 
 
1285 aa  496  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1210  cobaltochelatase  29.19 
 
 
1210 aa  493  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4814  magnesium chelatase subunit H  36.79 
 
 
1238 aa  491  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0476197 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0835  cobaltochelatase  29.84 
 
 
1242 aa  491  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0483092  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  28.92 
 
 
1258 aa  490  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  30.51 
 
 
1302 aa  487  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  30.6 
 
 
1293 aa  487  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1846  magnesium chelatase subunit H  35.34 
 
 
1234 aa  485  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.329456  normal  0.0615578 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2082  cobaltochelatase  29.7 
 
 
1297 aa  484  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1005  Cobaltochelatase  30.04 
 
 
1298 aa  477  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3720  magnesium chelatase subunit H  35.1 
 
 
1244 aa  474  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.683801  hitchhiker  0.00437109 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5359  magnesium chelatase subunit H  35.52 
 
 
1241 aa  474  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.877456  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0558  cobaltochelatase, CobN subunit  30.05 
 
 
1453 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  28.45 
 
 
1256 aa  464  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  28.23 
 
 
1220 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  30.26 
 
 
1237 aa  461  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0126  cobaltochelatase  27.58 
 
 
1291 aa  459  1e-127  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.48483  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  29.13 
 
 
1435 aa  455  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  29.99 
 
 
1270 aa  455  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  28.67 
 
 
1426 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3461  CobN/magnesium chelatase  28.74 
 
 
1304 aa  452  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  29.53 
 
 
1409 aa  452  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0749  cobalamin biosynthesis protein CobN, putative  30.17 
 
 
1244 aa  450  1.0000000000000001e-124  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1658  cobaltochelatase  30.23 
 
 
1551 aa  450  1.0000000000000001e-124  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  29.03 
 
 
1263 aa  445  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  29.52 
 
 
1406 aa  441  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1759  cobaltochelatase subunit CobN  27.22 
 
 
1273 aa  438  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193122  normal  0.0775991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  28.22 
 
 
1247 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  27.57 
 
 
1255 aa  431  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0292  CobN/magnesium chelatase  27.44 
 
 
1239 aa  425  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.431661  normal  0.307495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  28.46 
 
 
1222 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  27.69 
 
 
1247 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.265823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>