209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_10640 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_10640  coproporphyrinogen oxidase. coproporphyrinogen III oxidase. coproporphyrinogenase  100 
 
 
292 aa  613  9.999999999999999e-175  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15068  coproporphyrinogen III oxidase  71.38 
 
 
304 aa  454  1e-127  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30642  predicted protein  61.67 
 
 
368 aa  387  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00137682  normal  0.0422052 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64368  Oxygen-repressed protein  53.95 
 
 
323 aa  332  4e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.956921 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0950  coproporphyrinogen III oxidase  50.84 
 
 
300 aa  306  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00980  coproporphyrinogen oxidase, putative  50.61 
 
 
336 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00531403  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05130  coproporphyrinogen III oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07480)  48.18 
 
 
454 aa  305  7e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44982  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2369  coproporphyrinogen III oxidase  52.58 
 
 
303 aa  305  8.000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6503  coproporphyrinogen III oxidase  51.83 
 
 
303 aa  301  9e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.602583 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0674  coproporphyrinogen III oxidase  48.11 
 
 
317 aa  299  3e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0037  coproporphyrinogen III oxidase  50.17 
 
 
302 aa  298  6e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000149114 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  50.17 
 
 
302 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1891  coproporphyrinogen III oxidase  47.65 
 
 
345 aa  297  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388999  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  50.17 
 
 
302 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0037  coproporphyrinogen III oxidase  50.17 
 
 
323 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1148  coproporphyrinogen III oxidase  48.28 
 
 
346 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1178  coproporphyrinogen III oxidase  48.28 
 
 
346 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2263  coproporphyrinogen III oxidase  52.4 
 
 
296 aa  296  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.792963  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1910  coproporphyrinogen III oxidase  52.4 
 
 
296 aa  296  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0030  coproporphyrinogen III oxidase  50.17 
 
 
302 aa  295  5e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.378098  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4996  coproporphyrinogen III oxidase  46.86 
 
 
347 aa  293  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000411147  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1703  coproporphyrinogen III oxidase  50 
 
 
286 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.586163  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3053  coproporphyrinogen III oxidase  46.39 
 
 
344 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  49.49 
 
 
302 aa  292  4e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  0.00000553459 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  49.16 
 
 
302 aa  291  7e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  49.16 
 
 
302 aa  291  7e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4581  coproporphyrinogen III oxidase  46.37 
 
 
347 aa  291  8e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0050  coproporphyrinogen III oxidase  48.15 
 
 
304 aa  291  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646189  normal  0.257858 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0038  coproporphyrinogen III oxidase  48.82 
 
 
302 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2620  Coproporphyrinogen oxidase  45.91 
 
 
348 aa  290  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0030  coproporphyrinogen III oxidase  49.16 
 
 
310 aa  290  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210418  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0038  coproporphyrinogen III oxidase  48.48 
 
 
304 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03615  coproporphyrinogen III oxidase  48.16 
 
 
300 aa  286  2e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.94138  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0029  coproporphyrinogen III oxidase  48.99 
 
 
307 aa  285  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1166  coproporphyrinogen III oxidase  45.77 
 
 
343 aa  285  8e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000235619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0042  coproporphyrinogen III oxidase  47.81 
 
 
306 aa  284  9e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0059194  normal  0.559288 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  48.48 
 
 
303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  48.31 
 
 
304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2591  coproporphyrinogen III oxidase  49.83 
 
 
299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1223  coproporphyrinogen III oxidase  48.14 
 
 
311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1223  coproporphyrinogen III oxidase  48.14 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1864  coproporphyrinogen III oxidase  51.89 
 
 
302 aa  282  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1294  coproporphyrinogen III oxidase  46.78 
 
 
302 aa  282  5.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.770302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0073  coproporphyrinogen III oxidase  49.15 
 
 
303 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  hitchhiker  0.000371882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0022  coproporphyrinogen III oxidase  49.15 
 
 
304 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0449808  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1949  coproporphyrinogen III oxidase  51.2 
 
 
302 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.809347  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0025  coproporphyrinogen III oxidase  47.97 
 
 
303 aa  280  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0045  coproporphyrinogen III oxidase  47.81 
 
 
306 aa  280  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.253632 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1225  Coproporphyrinogen oxidase  49.83 
 
 
299 aa  279  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1193  Coproporphyrinogen oxidase  50.17 
 
 
327 aa  279  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  47.47 
 
 
305 aa  280  3e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2573  coproporphyrinogen III oxidase  49.83 
 
 
299 aa  279  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1243  coproporphyrinogen III oxidase  49.83 
 
 
299 aa  279  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0757  coproporphyrinogen III oxidase  48.82 
 
 
310 aa  278  8e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02336  coproporphyrinogen III oxidase  49.49 
 
 
299 aa  278  9e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02298  hypothetical protein  49.49 
 
 
299 aa  278  9e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0089  coproporphyrinogen III oxidase  48.47 
 
 
303 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.554189  hitchhiker  0.0000000000135583 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2711  coproporphyrinogen III oxidase  49.49 
 
 
299 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0089  coproporphyrinogen III oxidase  48.14 
 
 
303 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2722  coproporphyrinogen III oxidase  49.49 
 
 
299 aa  278  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20281  coproporphyrinogen III oxidase  46.69 
 
 
348 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2957  coproporphyrinogen III oxidase  49.16 
 
 
299 aa  278  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.929595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0092  coproporphyrinogen III oxidase  48.47 
 
 
303 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469648  hitchhiker  0.0000233392 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2645  coproporphyrinogen III oxidase  49.49 
 
 
299 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1918  coproporphyrinogen III oxidase  46.6 
 
 
299 aa  277  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.744913  normal  0.284298 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2596  coproporphyrinogen III oxidase  49.49 
 
 
299 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2817  coproporphyrinogen III oxidase  49.49 
 
 
299 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.56731  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1154  coproporphyrinogen III oxidase  46.37 
 
 
348 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2687  coproporphyrinogen III oxidase  49.83 
 
 
299 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.143173  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00220  coproporphyrinogen III oxidase  50.17 
 
 
309 aa  275  5e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333342  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0025  coproporphyrinogen III oxidase  48.47 
 
 
305 aa  275  6e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0993  coproporphyrinogen III oxidase  47.81 
 
 
310 aa  275  6e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2808  coproporphyrinogen III oxidase  49.16 
 
 
299 aa  275  6e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2294  Coproporphyrinogen oxidase  49.66 
 
 
304 aa  275  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.219751  hitchhiker  0.00200729 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17691  coproporphyrinogen III oxidase  44.97 
 
 
342 aa  275  8e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3996  coproporphyrinogen III oxidase  47.14 
 
 
312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.218154  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2014  coproporphyrinogen III oxidase  50.52 
 
 
302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.396638  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0060  coproporphyrinogen III oxidase  48.47 
 
 
304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2279  Coproporphyrinogen oxidase  46.96 
 
 
309 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.0202052 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17021  coproporphyrinogen III oxidase  45.74 
 
 
375 aa  272  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.18622  normal  0.770424 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3464  coproporphyrinogen III oxidase  48.15 
 
 
306 aa  272  6e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00280  coproporphyrinogen III oxidase  47.8 
 
 
305 aa  271  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.477574 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1393  coproporphyrinogen III oxidase  47.8 
 
 
309 aa  271  7e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.586678  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2784  coproporphyrinogen III oxidase  47.8 
 
 
309 aa  271  7e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390735 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1674  coproporphyrinogen III oxidase  44.34 
 
 
342 aa  271  8.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0469797  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2320  coproporphyrinogen III oxidase  48.45 
 
 
306 aa  271  8.000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.216124  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1280  coproporphyrinogen III oxidase  47.8 
 
 
309 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2863  coproporphyrinogen III oxidase  46.44 
 
 
307 aa  270  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2824  coproporphyrinogen III oxidase  45.95 
 
 
317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3211  Coproporphyrinogen oxidase  47.14 
 
 
311 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00028  coproporphyrinogen III oxidase  48.28 
 
 
310 aa  269  4e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14394  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0024  coproporphyrinogen III oxidase  47.12 
 
 
304 aa  269  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3290  Coproporphyrinogen oxidase  47.47 
 
 
312 aa  269  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00383  coproporphyrinogen III oxidase  46.67 
 
 
305 aa  268  8.999999999999999e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22671  coproporphyrinogen III oxidase  46.47 
 
 
357 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.364873 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3666  coproporphyrinogen III oxidase  49.49 
 
 
299 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2465  coproporphyrinogen III oxidase  47.33 
 
 
305 aa  267  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00683566  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3669  coproporphyrinogen III oxidase  46.39 
 
 
298 aa  266  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17891  coproporphyrinogen III oxidase  43.22 
 
 
342 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17731  coproporphyrinogen III oxidase  42.77 
 
 
342 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.932235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>