More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_10617 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_10617  predicted protein  100 
 
 		 229 aa  470  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.290577  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1716  50S ribosomal protein L3  54.21 
 
 		 240 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0849831  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0361  50S ribosomal protein L3  54.21 
 
 		 240 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1795  50S ribosomal protein L3P  52.09 
 
 		 268 aa  215  4e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.170696  normal  0.0358825 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0759  50S ribosomal protein L3  53.74 
 
 		 245 aa  214  8e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2534  50S ribosomal protein L3  53.74 
 
 		 239 aa  214  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.129465  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0276  50S ribosomal protein L3  54.67 
 
 		 279 aa  213  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.948053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1840  50S ribosomal protein L3  52.58 
 
 		 213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.053801  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0698  50S ribosomal protein L3  52.8 
 
 		 246 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000853628  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0666  50S ribosomal protein L3  52.8 
 
 		 246 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000700021  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0583  50S ribosomal protein L3  52.8 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0246  50S ribosomal protein L3  54.88 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.982555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1908  50S ribosomal protein L3  52.8 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0000666211  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1332  50S ribosomal protein L3  51.64 
 
 		 213 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502472  normal  0.17387 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2736  ribosomal protein L3  54.46 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.301212  normal  0.0821652 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1354  50S ribosomal protein L3  53.74 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.03305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0353  50S ribosomal protein L3  51.87 
 
 		 246 aa  206  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1430  50S ribosomal protein L3  51.17 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0544436  normal  0.0131541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1678  50S ribosomal protein L3  52.58 
 
 		 242 aa  206  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0571094  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1956  50S ribosomal protein L3  53.52 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00677731  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2218  50S ribosomal protein L3  50.47 
 
 		 241 aa  205  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1196  50S ribosomal protein L3  52.58 
 
 		 237 aa  204  8e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1233  50S ribosomal protein L3  52.58 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.180117  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2440  50S ribosomal protein L3  50.93 
 
 		 246 aa  203  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1545  50S ribosomal protein L3  52.8 
 
 		 241 aa  202  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2162  50S ribosomal protein L3  50.93 
 
 		 246 aa  203  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3667  50S ribosomal protein L3  52.8 
 
 		 241 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1614  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2123  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2688  50S ribosomal protein L3  50.93 
 
 		 235 aa  202  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.160659  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3448  50S ribosomal protein L3  51.87 
 
 		 243 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.925386 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1679  50S ribosomal protein L3  51.4 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.123125  hitchhiker  0.0000530368 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0986  50S ribosomal protein L3  49.3 
 
 		 228 aa  200  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191064  normal  0.0173239 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2295  50S ribosomal protein L3  51.87 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.208752 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3184  50S ribosomal protein L3  51.4 
 
 		 241 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1364  50S ribosomal protein L3  51.4 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.803937  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1249  50S ribosomal protein L3  52.8 
 
 		 251 aa  197  9e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5070  50S ribosomal protein L3  50.93 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.621506 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0580  50S ribosomal protein L3  51.4 
 
 		 245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1946  50S ribosomal protein L3  49.3 
 
 		 227 aa  192  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2818  50S ribosomal protein L3  52.58 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.469348 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2966  50S ribosomal protein L3  49.53 
 
 		 227 aa  191  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0816974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_6632  Putative mitochondrial ribosomal protein L3  50.46 
 
 		 211 aa  191  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0234782  hitchhiker  0.000000645255 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1353  50S ribosomal protein L3  50.23 
 
 		 317 aa  186  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.685053  normal  0.045909 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04308  50S ribosomal protein L3 (AFU_orthologue; AFUA_4G06000)  47.96 
 
 		 296 aa  182  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.569761  normal  0.446877 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0612  50S ribosomal protein L3  46.76 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  47.39 
 
 		 212 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0409  50S ribosomal protein L3  45.83 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.214097  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3999  50S ribosomal protein L3  48.15 
 
 		 226 aa  175  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166113 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0626  ribosomal protein L3  47.39 
 
 		 211 aa  175  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000165351  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4548  50S ribosomal protein L3  47.39 
 
 		 211 aa  174  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00256892  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  46.7 
 
 		 209 aa  174  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0405  50S ribosomal protein L3P  47.42 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  unclonable  0.0000000000324929  normal  0.15101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5079  50S ribosomal protein L3  47.17 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374535  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  46.23 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2169  50S ribosomal protein L3  49.77 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000300239  normal  0.384776 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  49.06 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02690  ribosomal large subunit assembly and maintenance-related protein, putative  45 
 
 		 308 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.881266  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2324  ribosomal protein L3  44.6 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000235705  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3909  50S ribosomal protein L3  47.87 
 
 		 209 aa  171  9e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.031884  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0454  50S ribosomal protein L3  47.87 
 
 		 211 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00952841  unclonable  0.000000209689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4749  50S ribosomal protein L3  47.87 
 
 		 211 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000212363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  45.97 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0484  50S ribosomal protein L3  47.87 
 
 		 211 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000200613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0487  50S ribosomal protein L3  47.87 
 
 		 211 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000838631  normal  0.0709669 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0273  50S ribosomal protein L3  47.66 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000366458  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0278  50S ribosomal protein L3  47.66 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000211938  decreased coverage  0.00000000129288 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  47.42 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  45.97 
 
 		 219 aa  169  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  46.23 
 
 		 209 aa  169  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  45.75 
 
 		 209 aa  169  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0279  50S ribosomal protein L3  45.07 
 
 		 214 aa  168  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000003338  unclonable  0.000000102958 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0327  50S ribosomal protein L3  47.39 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0497  50S ribosomal protein L3  47.39 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.443535  hitchhiker  0.00000000471094 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  45.75 
 
 		 209 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0266  ribosomal protein L3  49.07 
 
 		 210 aa  167  2e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.0000000000356629  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0391  50S ribosomal protein L3  45.21 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000698132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  43.78 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  45.02 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0719  ribosomal protein L3  46.01 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000525785  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34483  predicted protein  45.05 
 
 		 262 aa  165  5e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000711163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4276  ribosomal protein L3  45.45 
 
 		 212 aa  165  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000028687  unclonable  0.00000000000491767 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3822  50S ribosomal protein L3  45.75 
 
 		 209 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000994751  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  44.44 
 
 		 218 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3443  50S ribosomal protein L3  46.51 
 
 		 247 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000129848  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4001  50S ribosomal protein L3  45.28 
 
 		 209 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000133554  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  44.39 
 
 		 214 aa  164  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0338  50S ribosomal protein L3  45.33 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274222  decreased coverage  0.000311926 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  47.89 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000015584  hitchhiker  0.00000758128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0837  50S ribosomal protein L3  46.45 
 
 		 211 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361687  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  44.65 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  44.91 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08850  50S ribosomal protein L3  46.45 
 
 		 211 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000230335  normal  0.0234155 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4913  50S ribosomal protein L3  45.79 
 
 		 226 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00251627  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  46.45 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3795  50S ribosomal protein L3  44.39 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000167739  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  44.81 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2372  ribosomal protein L3  43.66 
 
 		 211 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0426  50S ribosomal protein L3  45.07 
 
 		 212 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000808775  hitchhiker  0.0000319768 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  43.98 
 
 		 217 aa  161  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>