22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_10518 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_10518  predicted protein  100 
 
 
125 aa  254  3e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13445  APS reductase  36.56 
 
 
415 aa  54.7  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.927166 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5385  predicted protein  40 
 
 
184 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.117735 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02671  thioredoxin-like protein TxlA  26.44 
 
 
188 aa  43.9  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01370  conserved hypothetical protein  25.26 
 
 
570 aa  43.9  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  30.34 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1389  thioredoxin domain-containing protein  25 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.276518  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0062  thioredoxin  28.99 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0275  thioredoxin family protein  28.87 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0448  thioredoxin  26.32 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  32.84 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0274  thioredoxin-like protein TxlA  27.08 
 
 
191 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0377  thioredoxin  27.69 
 
 
145 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655114  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2070  thioredoxin-like protein TxlA  30.43 
 
 
185 aa  41.2  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32213  predicted protein  24.82 
 
 
310 aa  41.6  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0281124 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1263  Thioredoxin domain protein  30.85 
 
 
189 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316864  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  28.74 
 
 
107 aa  40.4  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  29.89 
 
 
109 aa  40.4  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  26.44 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  25 
 
 
165 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5974  thioredoxin domain protein  27.08 
 
 
102 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.897668  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  27.62 
 
 
140 aa  40  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>