More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_10458 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_10458  predicted protein  100 
 
 
171 aa  352  2e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.013689  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14523  predicted protein  44.38 
 
 
160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06189  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G11700)  52.63 
 
 
176 aa  120  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0196952 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56209  diadenosine polyphosphate hydrolase  39.33 
 
 
179 aa  96.7  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.270188 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  42.42 
 
 
139 aa  84.3  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  42.42 
 
 
139 aa  80.5  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  32.74 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1483  hypothetical protein  40 
 
 
142 aa  73.6  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  34.59 
 
 
146 aa  73.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1102  hypothetical protein  34.07 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  42.35 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6595  histidine triad (HIT) protein  33.59 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  38.61 
 
 
135 aa  70.5  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  31.19 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1025  histidine triad (HIT) protein  35.4 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  35.48 
 
 
1077 aa  67.4  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0141  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
144 aa  67  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1004  histidine triad (HIT) protein  35.96 
 
 
125 aa  67  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  35 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0010  histidine triad (HIT) protein  39.77 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0387329  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0450  hypothetical protein  35.79 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0142  histidine triad (HIT) protein  31.82 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3878  histidine triad (HIT) protein  35.48 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3349  histidine triad (HIT) protein  32.5 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425203 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1209  histidine triad (HIT) protein  32.58 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.818472  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0919  histidine triad (HIT) protein  35.92 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420438  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4872  histidine triad (HIT) protein  33.68 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1576  putative hydrolase  34.48 
 
 
182 aa  63.9  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.031095  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2598  histidine triad (HIT) protein  28.69 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  33.58 
 
 
138 aa  63.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0077  histidine triad (HIT) protein  37.37 
 
 
138 aa  63.5  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  32.52 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
145 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  36.47 
 
 
140 aa  63.2  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  41.18 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2372  histidine triad (HIT) protein  35.71 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
143 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  30.83 
 
 
149 aa  62.4  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  38.1 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1612  histidine triad (HIT) protein  38.64 
 
 
173 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0620  histidine triad (HIT) protein  35.05 
 
 
163 aa  62  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00610052  hitchhiker  0.000000200539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3837  histidine triad (HIT) protein  38.3 
 
 
182 aa  62  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.868089  normal  0.143653 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2282  histidine triad (HIT) protein  39.29 
 
 
244 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.983913  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15420  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  38.3 
 
 
187 aa  62  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0547976  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0327  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
144 aa  62  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0007671  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2243  histidine triad (HIT) protein  39.29 
 
 
220 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118301  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  35.29 
 
 
131 aa  62  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2290  histidine triad (HIT) protein  39.29 
 
 
244 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358271  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0187  histidine triad (HIT) protein  33.68 
 
 
164 aa  61.2  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.414611  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1420  histidine triad (HIT) protein  32.21 
 
 
179 aa  61.2  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1783  histidine triad (HIT) protein  33.66 
 
 
148 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.344857  normal  0.911997 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04560  histidine triad (HIT) protein  32.18 
 
 
122 aa  60.8  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1225  histidine triad (HIT) protein  35.23 
 
 
171 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0862  histidine triad (HIT) protein  34.78 
 
 
140 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.379989  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1524  histidine triad (HIT) protein  35.11 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  32.99 
 
 
145 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  35.05 
 
 
144 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  33.72 
 
 
289 aa  60.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0788  histidine triad (HIT) protein  39.25 
 
 
113 aa  60.5  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.927193  normal  0.0285897 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3809  histidine triad (HIT) protein  36.71 
 
 
133 aa  60.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197548  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2559  histidine triad (HIT) protein  38.3 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00190  hydrolase, putative  37.65 
 
 
140 aa  60.1  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1435  histidine triad (HIT) protein  35.44 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  36.47 
 
 
143 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4113  histidine triad (HIT) protein  29.07 
 
 
289 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  35.63 
 
 
139 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf126  HINT (histidine triad nucleotide-binding protein) family member  29.03 
 
 
107 aa  59.7  0.00000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  36.47 
 
 
143 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01700  HIT family protein  41.03 
 
 
129 aa  58.9  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127711  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12632  hypothetical protein  38.64 
 
 
195 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0100073  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2135  histidine triad (HIT) protein  35.48 
 
 
148 aa  59.3  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.605825  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3968  histidine triad (HIT) protein  36.47 
 
 
143 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777319  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2227  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  36.36 
 
 
122 aa  58.9  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0929  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  32.94 
 
 
126 aa  59.3  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.685079  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0494  putative HIT-like protein  38.1 
 
 
144 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1920  histidine triad (HIT) protein  40.24 
 
 
182 aa  58.5  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.629691  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1076  histidine triad (HIT) protein  31.62 
 
 
146 aa  58.5  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  34.52 
 
 
141 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1659  histidine triad (HIT) protein  33.75 
 
 
125 aa  58.5  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.490499  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  32.53 
 
 
138 aa  58.2  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2525  histidine triad (HIT) protein  33.68 
 
 
181 aa  58.2  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.184582 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  30.97 
 
 
139 aa  58.2  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  32.99 
 
 
145 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1228  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
163 aa  58.2  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  29.37 
 
 
142 aa  58.2  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1878  histidine triad (HIT) protein  37.23 
 
 
172 aa  58.2  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1430  HIT family hydrolase  36.56 
 
 
111 aa  57.8  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  32.08 
 
 
115 aa  57.8  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01311  HIT (histidine triad) family protein  36.56 
 
 
111 aa  57.8  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1617  histidine triad (HIT) protein  34.18 
 
 
153 aa  57.8  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.634502  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1591  histidine triad (HIT) protein  30.4 
 
 
129 aa  57.8  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0927  HIT family hydrolase  29.47 
 
 
162 aa  57.4  0.00000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0143  histidine triad domain-containing protein  29.37 
 
 
161 aa  57.4  0.00000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  30 
 
 
131 aa  57  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1324  Hit family protein  33.68 
 
 
165 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1360  histidine triad (HIT) protein  35.23 
 
 
192 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1499  histidine triad (HIT) protein  34.09 
 
 
301 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.348624  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0312  histidine triad (HIT) protein  32.05 
 
 
110 aa  57  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0762523  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42119  protein kinase C inhibitor-I, histidine triad nucleotide-binding protein-like protein  34.88 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.149088 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>