59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_10438 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_10438  PDS-like 1, phytoene desaturase-like protein, phytoene dehydrogenase-like protein  100 
 
 		 545 aa  1121    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33779  predicted protein  57.89 
 
 		 578 aa  605  9.999999999999999e-173  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11831  zeta-carotene desaturase-like protein  51.7 
 
 		 543 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.253964 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1093  zeta-carotene desaturase-like  50.28 
 
 		 544 aa  518  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.802606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1346  zeta-carotene desaturase-like  50.48 
 
 		 543 aa  513  1e-144  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  37.25 
 
 		 500 aa  299  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  35.52 
 
 		 503 aa  296  8e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  34.57 
 
 		 520 aa  276  8e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  29.44 
 
 		 506 aa  222  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54051  pds-like2, phytoene desaturase-like protein  29.3 
 
 		 605 aa  181  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.250882  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43187  predicted protein  28.85 
 
 		 557 aa  163  7e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.140423  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  23.67 
 
 		 453 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  23.31 
 
 		 453 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  21.54 
 
 		 599 aa  62.4  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  22.49 
 
 		 455 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  22.67 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  23.33 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  22.41 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  21.79 
 
 		 453 aa  57  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  20.13 
 
 		 460 aa  56.6  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  22.03 
 
 		 474 aa  56.2  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  21.85 
 
 		 552 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  24.09 
 
 		 506 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  24.09 
 
 		 506 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  24.5 
 
 		 506 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  23.35 
 
 		 473 aa  54.7  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  22.44 
 
 		 453 aa  55.1  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  21.01 
 
 		 461 aa  54.3  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  21.34 
 
 		 477 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1580  amine oxidase  25.28 
 
 		 481 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128087  normal  0.0872032 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  20.5 
 
 		 624 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3090  putative beta-carotene desaturase/methylase  25.33 
 
 		 520 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  21.61 
 
 		 471 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1844  amine oxidase  25.67 
 
 		 511 aa  52  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  21.83 
 
 		 473 aa  52  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4947  amine oxidase  23.67 
 
 		 551 aa  51.2  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00497379  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  20.94 
 
 		 486 aa  50.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  22.13 
 
 		 479 aa  50.4  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  23.77 
 
 		 811 aa  50.4  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  20.84 
 
 		 479 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  21.82 
 
 		 589 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  22.36 
 
 		 472 aa  49.3  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  20.94 
 
 		 459 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  20.34 
 
 		 486 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  21.94 
 
 		 459 aa  47  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.22 
 
 		 643 aa  45.8  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.93 
 
 		 639 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2500  amine oxidase  25.91 
 
 		 519 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00015741  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3570  amine oxidase  24.91 
 
 		 546 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  21.49 
 
 		 464 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  21.51 
 
 		 475 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0877  Carotene 7,8-desaturase  22.54 
 
 		 460 aa  45.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0378337  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  20.93 
 
 		 478 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  22.2 
 
 		 462 aa  44.7  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  26.53 
 
 		 461 aa  44.3  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  21.36 
 
 		 475 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  31.96 
 
 		 353 aa  43.9  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  22.3 
 
 		 647 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  22.3 
 
 		 647 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>