11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_10293 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_10293  predicted protein  100 
 
 
289 aa  599  1e-170  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0891574  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46645  predicted protein  45.17 
 
 
377 aa  234  9e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16105  predicted protein  34.27 
 
 
272 aa  159  4e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0443803  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3819  predicted protein  30.58 
 
 
332 aa  142  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4198  predicted protein  29.63 
 
 
304 aa  129  8.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02700  conserved hypothetical protein  32.75 
 
 
796 aa  127  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.738564  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11183  predicted protein  29.93 
 
 
266 aa  127  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.621413  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00410  hypothetical protein  27.27 
 
 
466 aa  93.6  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0252684  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63490  predicted protein  26.69 
 
 
553 aa  93.2  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02232  DUF300 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07250)  22.87 
 
 
542 aa  80.5  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.826222  hitchhiker  0.00608886 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06328  DUF300 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G13512)  28.26 
 
 
490 aa  73.6  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.622915  normal  0.106438 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>