104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_10282 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_10282  predicted protein  100 
 
 		 614 aa  1271    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37740  predicted protein  34.5 
 
 		 849 aa  382  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689797  normal  0.0804873 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  33.84 
 
 		 849 aa  366  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10414  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05590)  32.82 
 
 		 841 aa  347  5e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  30.91 
 
 		 835 aa  335  2e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  28.39 
 
 		 749 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32894  predicted protein  27.8 
 
 		 1067 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0780237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  27.48 
 
 		 791 aa  197  3e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  24.96 
 
 		 938 aa  179  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  26.91 
 
 		 799 aa  111  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  26.71 
 
 		 782 aa  110  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  26.35 
 
 		 793 aa  110  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  24.85 
 
 		 788 aa  106  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  24.12 
 
 		 634 aa  104  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  26.98 
 
 		 791 aa  104  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  21.85 
 
 		 723 aa  89  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  22.91 
 
 		 739 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  20.22 
 
 		 729 aa  84.3  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  22.54 
 
 		 670 aa  80.9  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  21.15 
 
 		 712 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  22.96 
 
 		 739 aa  76.6  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  21.25 
 
 		 654 aa  75.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  23.83 
 
 		 773 aa  72.8  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  20.3 
 
 		 785 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  21.85 
 
 		 676 aa  70.9  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  26.05 
 
 		 722 aa  69.7  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  25.86 
 
 		 669 aa  66.6  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  21.36 
 
 		 781 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0134  DEAD_2 domain-containing protein  27.85 
 
 		 537 aa  66.2  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00117441 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  27.53 
 
 		 723 aa  66.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  24.72 
 
 		 574 aa  64.3  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  34.82 
 
 		 798 aa  64.3  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  27.98 
 
 		 798 aa  64.3  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  25.19 
 
 		 773 aa  62.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1536  DEAD_2 domain protein  25.62 
 
 		 537 aa  61.2  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.849616  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  32.99 
 
 		 773 aa  61.2  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  26.32 
 
 		 619 aa  60.8  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  26.82 
 
 		 801 aa  58.2  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  25.44 
 
 		 807 aa  57.8  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  22.39 
 
 		 758 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  25.19 
 
 		 750 aa  57  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  28.29 
 
 		 790 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0534  helicase c2  25.48 
 
 		 669 aa  55.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  22.39 
 
 		 758 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  25.91 
 
 		 779 aa  55.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  30.93 
 
 		 726 aa  55.5  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  27.92 
 
 		 617 aa  55.5  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  22.51 
 
 		 580 aa  55.1  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 582 aa  54.7  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  26.95 
 
 		 790 aa  54.3  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  22.7 
 
 		 772 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  22.52 
 
 		 781 aa  53.5  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0371  DNA repair helicase RAD3  23.16 
 
 		 669 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  22.56 
 
 		 753 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  23.99 
 
 		 775 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  22.05 
 
 		 575 aa  52.8  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  23.93 
 
 		 766 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  29.63 
 
 		 797 aa  53.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  22.11 
 
 		 669 aa  52.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  21.47 
 
 		 788 aa  52.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  22.9 
 
 		 762 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  22.9 
 
 		 753 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  21.99 
 
 		 669 aa  52.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  24.01 
 
 		 757 aa  51.6  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  23.53 
 
 		 766 aa  51.6  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  26.67 
 
 		 806 aa  51.6  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  24.18 
 
 		 798 aa  51.2  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  23.53 
 
 		 766 aa  50.8  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  24.83 
 
 		 541 aa  50.4  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  32.41 
 
 		 790 aa  50.4  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  28.04 
 
 		 761 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  23.28 
 
 		 766 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  27.62 
 
 		 756 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  18.8 
 
 		 777 aa  50.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  30.84 
 
 		 745 aa  49.3  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  23.53 
 
 		 766 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  23.53 
 
 		 766 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  29 
 
 		 588 aa  48.5  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1461  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.13 
 
 		 732 aa  48.9  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.498771 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  23.62 
 
 		 766 aa  48.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  26.42 
 
 		 753 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  32.41 
 
 		 746 aa  48.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  32.41 
 
 		 755 aa  48.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  32.41 
 
 		 755 aa  48.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  27.37 
 
 		 550 aa  47.4  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.59 
 
 		 921 aa  47.4  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  27.1 
 
 		 773 aa  46.6  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2732  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.45 
 
 		 738 aa  46.6  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.196414  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  26.09 
 
 		 852 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2515  helicase c2  28.83 
 
 		 917 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2213  helicase c2  28 
 
 		 644 aa  47  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23708 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2975  helicase c2  45 
 
 		 807 aa  46.6  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1359  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.22 
 
 		 978 aa  46.6  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.838712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  22.41 
 
 		 874 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  26.5 
 
 		 787 aa  46.2  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1203  helicase c2  26.56 
 
 		 583 aa  46.2  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.281396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1863  helicase c2  27.59 
 
 		 668 aa  45.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879395 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  21.67 
 
 		 774 aa  45.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1552  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.77 
 
 		 699 aa  45.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  25.82 
 
 		 754 aa  44.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>