More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_10257 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_10257  predicted protein  100 
 
 
459 aa  945    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.144929  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10073  predicted protein  42.47 
 
 
431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  44.61 
 
 
397 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.98 
 
 
385 aa  266  4e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  40.87 
 
 
395 aa  260  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  42.65 
 
 
395 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  39.51 
 
 
395 aa  254  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  39.02 
 
 
401 aa  252  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  37.8 
 
 
387 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  39 
 
 
391 aa  251  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  38.24 
 
 
402 aa  251  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2069  aminotransferase, class I and II  39.85 
 
 
375 aa  249  6e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.708727 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00190  aminotransferase, putative  33.81 
 
 
460 aa  249  9e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00967249  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  40.05 
 
 
409 aa  249  9e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2062  aminotransferase class I and II  37.87 
 
 
374 aa  245  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.422192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  39.6 
 
 
387 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  38.63 
 
 
386 aa  241  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  39.04 
 
 
413 aa  240  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  38.48 
 
 
393 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  38.33 
 
 
389 aa  238  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  38.25 
 
 
391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  39.65 
 
 
421 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  35.06 
 
 
382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3495  putative aminotransferase  34.81 
 
 
382 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  38.52 
 
 
408 aa  231  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  32.68 
 
 
390 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1518  aminotransferase class I and II  34.98 
 
 
374 aa  231  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.489896 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  37.35 
 
 
413 aa  230  4e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  39.6 
 
 
381 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  39.3 
 
 
400 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  38.15 
 
 
387 aa  227  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  38.41 
 
 
397 aa  227  4e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14940  putative aminotransferase  34.51 
 
 
382 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.779314 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1317  putative aminotransferase  35.84 
 
 
382 aa  226  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  36.92 
 
 
394 aa  226  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1935  aminotransferase class I and II  37.16 
 
 
383 aa  225  1e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  35.32 
 
 
382 aa  225  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  37.16 
 
 
392 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  34.42 
 
 
397 aa  224  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0852  aminotransferase class I and II  34.25 
 
 
384 aa  224  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1046  aminotransferase class I and II  38.67 
 
 
402 aa  223  8e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  36.99 
 
 
387 aa  221  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45065  predicted protein  32.85 
 
 
434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.368753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  37.19 
 
 
382 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  34.67 
 
 
379 aa  219  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  34.49 
 
 
400 aa  218  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  38.65 
 
 
387 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  36.59 
 
 
397 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  35.07 
 
 
391 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2698  putative aminotransferase  35.01 
 
 
382 aa  218  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  36.1 
 
 
397 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08850  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  37 
 
 
417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4804  aminotransferase class I and II  34.69 
 
 
413 aa  217  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.607245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0910  aminotransferase class I and II  34.21 
 
 
421 aa  217  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  36.45 
 
 
391 aa  217  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  36.39 
 
 
389 aa  216  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  36.82 
 
 
389 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1616  putative aminotransferase  34.34 
 
 
410 aa  216  7e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00117595  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00866  putative aminotransferase  34.26 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.387551  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0752  aminotransferase, class I and II  33.59 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06061  putative aminotransferase  34.26 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0129479  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1253  putative aminotransferase  33.25 
 
 
382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0014  putative aminotransferase  33.84 
 
 
384 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.167209 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05616  kynurenine aminotransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11190)  34.66 
 
 
418 aa  213  4.9999999999999996e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0167824 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  33.25 
 
 
382 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  37.16 
 
 
388 aa  212  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1235  aminotransferase class I and II  30.9 
 
 
393 aa  212  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  36.07 
 
 
384 aa  212  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0901  putative aminotransferase  32.75 
 
 
382 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1559  putative aminotransferase  34.09 
 
 
410 aa  211  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000413042  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1369  putative aminotransferase  35.82 
 
 
384 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0858  putative aminotransferase  32.75 
 
 
382 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0888  putative aminotransferase  32.75 
 
 
382 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.533677 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  35.31 
 
 
390 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0778  aminotransferase class I and II  32.41 
 
 
380 aa  209  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  34.34 
 
 
385 aa  209  9e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  35 
 
 
385 aa  209  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  32.64 
 
 
393 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0109  putative aminotransferase  34.9 
 
 
384 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0119  putative aminotransferase  34.65 
 
 
384 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.234511  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0119  putative aminotransferase  34.16 
 
 
384 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2936  putative aminotransferase  34.65 
 
 
384 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1558  aminotransferase class I and II  33.76 
 
 
386 aa  207  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0317788  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0031  putative aminotransferase  34.16 
 
 
384 aa  207  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2490  putative aminotransferase  32.74 
 
 
391 aa  207  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.228647  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  37.06 
 
 
389 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  34.41 
 
 
390 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  37.06 
 
 
389 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1969  putative aminotransferase  36 
 
 
389 aa  206  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  36.39 
 
 
397 aa  207  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4320  putative aminotransferase  31.49 
 
 
382 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3813  aminotransferase  32.54 
 
 
405 aa  206  6e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  34.91 
 
 
390 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  33.08 
 
 
386 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0133  putative aminotransferase  34.41 
 
 
384 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  33.92 
 
 
390 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0118  putative aminotransferase  34.9 
 
 
384 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  33.08 
 
 
386 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4435  putative aminotransferase  33.75 
 
 
384 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  35.38 
 
 
400 aa  206  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>