50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_9879 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_9879  predicted protein  100 
 
 		 188 aa  386  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.753142  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7521  predicted protein  55.62 
 
 		 212 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0283312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0382  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.31 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0582701  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2923  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.26 
 
 		 220 aa  67  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3072  HAD family hydrolase  27.07 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791447  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0010  pyrimidine 5'-nucleotidase  27.72 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32249  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2986  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.11 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0234941  hitchhiker  0.000703738 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1026  HAD superfamily hydrolase  33.81 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06325  pyrimidine 5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13470)  28.43 
 
 		 223 aa  64.3  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.882261  normal  0.0669048 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0967  HAD superfamily hydrolase  33.81 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2297  pyrimidine 5-nucleotidase  28.18 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4559  pyrimidine 5'-nucleotidase  30 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1899  pyrimidine 5'-nucleotidase  27.62 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0074  pyrimidine 5-nucleotidase  25.97 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0812  pyrimidine 5-nucleotidase  25.41 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935066  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7331  HAD-superfamily hydrolase  27.32 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1204  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.43 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00476471 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2827  pyrimidine 5-nucleotidase  27.22 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112564  normal  0.0242793 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3343  pyrimidine 5-nucleotidase  30.11 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0449  hydrolase  29.93 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0294  pyrimidine 5'-nucleotidase  27.87 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2912  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.93 
 
 		 280 aa  54.7  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0455  pyrimidine 5'-nucleotidase  27.41 
 
 		 240 aa  53.9  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0631  pyrimidine 5'-nucleotidase  25.7 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3331  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.28 
 
 		 268 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.142582 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0071  pyrimidine 5'-nucleotidase  27.72 
 
 		 237 aa  52.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2256  pyrimidine 5-nucleotidase  27.07 
 
 		 241 aa  52.4  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  hitchhiker  0.0000228381 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84214  suppressor of deletion of TFIIS  24.88 
 
 		 287 aa  52.4  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538947  normal  0.0127046 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1357  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.37 
 
 		 234 aa  52.4  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1385  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.44 
 
 		 243 aa  52  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0603953  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0082  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.06 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2296  pyrimidine 5'-nucleotidase  27.93 
 
 		 243 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.310547 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0867  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.28 
 
 		 243 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1870  hydrolase  25.82 
 
 		 215 aa  48.5  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0520  pyrimidine 5'-nucleotidase  25.82 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1243  pyrimidine 5-nucleotidase  24.58 
 
 		 213 aa  48.5  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.882257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0678  pyrimidine 5-nucleotidase  23.76 
 
 		 236 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2620  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.49 
 
 		 248 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2341  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.49 
 
 		 248 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3070  pyrimidine 5-nucleotidase  25.41 
 
 		 238 aa  48.1  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18726  predicted protein  34.34 
 
 		 273 aa  48.1  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.245332 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0955  pyrimidine 5'-nucleotidase  27.22 
 
 		 249 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0065  pyrimidine 5'-nucleotidase  25.53 
 
 		 237 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.284923  decreased coverage  0.00705345 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0657  pyrimidine 5'-nucleotidase  25.68 
 
 		 215 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.114356 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1534  pyrimidine 5'-nucleotidase  23.5 
 
 		 216 aa  45.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.78669  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2390  putative pyrimidine 5'-nucleotidase  23.76 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0500  hypothetical protein  25.51 
 
 		 243 aa  45.4  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2059  pyrimidine 5'-nucleotidase  24.09 
 
 		 214 aa  44.7  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288048  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1023  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.82 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  24.32 
 
 		 221 aa  42  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>