More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_9327 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_20951  preprotein translocase subunit SecA  44.69 
 
 
944 aa  742    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.396844  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36933  predicted protein  44.12 
 
 
932 aa  739    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00575996  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18491  preprotein translocase subunit SecA  42.86 
 
 
943 aa  714    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1220  preprotein translocase subunit SecA  44 
 
 
942 aa  729    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0984174  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2124  preprotein translocase subunit SecA  44.88 
 
 
930 aa  761    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9327  nuclear-encoded-like protein of plastid sec  100 
 
 
935 aa  1915    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0123  preprotein translocase subunit SecA  43.76 
 
 
937 aa  744    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0081  preprotein translocase subunit SecA  44.68 
 
 
934 aa  749    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1732  preprotein translocase subunit SecA  42.84 
 
 
943 aa  721    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.40392  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0289  preprotein translocase subunit SecA  43.66 
 
 
948 aa  736    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3658  preprotein translocase subunit SecA  45.82 
 
 
932 aa  773    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3269  preprotein translocase subunit SecA  44.3 
 
 
930 aa  753    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.659799  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18301  preprotein translocase subunit SecA  43.04 
 
 
943 aa  705    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18281  preprotein translocase subunit SecA  43.6 
 
 
943 aa  743    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4635  preprotein translocase subunit SecA  45.4 
 
 
936 aa  744    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.226506  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17671  preprotein translocase subunit SecA  43.19 
 
 
945 aa  716    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0032  preprotein translocase subunit SecA  44.55 
 
 
935 aa  759    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1077  preprotein translocase subunit SecA  44.06 
 
 
935 aa  733    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01511  preprotein translocase subunit SecA  42.84 
 
 
951 aa  714    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1106  preprotein translocase subunit SecA  44.06 
 
 
935 aa  733    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  40.97 
 
 
888 aa  635  1e-180  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  40.09 
 
 
896 aa  622  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4277  preprotein translocase, SecA subunit  41.14 
 
 
1075 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.259413  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5838  preprotein translocase subunit SecA  39.93 
 
 
1018 aa  596  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198512  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1457  preprotein translocase subunit SecA  37.73 
 
 
912 aa  592  1e-167  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.34304  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1385  preprotein translocase subunit SecA  37.37 
 
 
910 aa  586  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  38.44 
 
 
958 aa  588  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3807  preprotein translocase, SecA subunit  39.41 
 
 
895 aa  587  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0963816  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  38.12 
 
 
957 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0910  preprotein translocase, SecA subunit  39.8 
 
 
971 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.822535  normal  0.604814 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1759  preprotein translocase subunit SecA  39.43 
 
 
1009 aa  585  1.0000000000000001e-165  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08660  protein translocase subunit secA  39.2 
 
 
901 aa  582  1e-164  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101262  normal  0.855106 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1249  preprotein translocase, SecA subunit  37.69 
 
 
904 aa  581  1e-164  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0777  preprotein translocase subunit SecA  39.43 
 
 
933 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.648887  normal  0.618411 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2000  preprotein translocase, SecA subunit  39.96 
 
 
934 aa  573  1.0000000000000001e-162  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000011814 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05460  protein translocase subunit secA  38.98 
 
 
945 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2855  protein translocase subunit secA  37.37 
 
 
993 aa  566  1e-160  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09420  protein translocase subunit secA  39.37 
 
 
931 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.915131 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1081  preprotein translocase, SecA subunit  37.62 
 
 
917 aa  561  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20600  protein translocase subunit secA  38.95 
 
 
985 aa  561  1e-158  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.648191  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  42.61 
 
 
1067 aa  558  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0973  preprotein translocase, SecA subunit  38.86 
 
 
971 aa  557  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16094  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3014  preprotein translocase subunit SecA  38.82 
 
 
910 aa  557  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09010  protein translocase subunit secA  37.12 
 
 
920 aa  547  1e-154  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.665713  normal  0.0250229 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  37.28 
 
 
980 aa  545  1e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  36.54 
 
 
962 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  37.24 
 
 
962 aa  542  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  36.72 
 
 
962 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49779  predicted protein  39.36 
 
 
918 aa  536  1e-151  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.894811  normal  0.0907147 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1021  preprotein translocase subunit SecA  36.52 
 
 
906 aa  537  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1871  preprotein translocase subunit SecA  36.74 
 
 
906 aa  536  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25156  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0526  preprotein translocase subunit SecA  36.34 
 
 
947 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723301  normal  0.383723 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0530  preprotein translocase subunit SecA  36.97 
 
 
946 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.630171  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7588  preprotein translocase subunit SecA  36.81 
 
 
950 aa  522  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.334261 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0390  preprotein translocase subunit SecA  36.12 
 
 
953 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  35.58 
 
 
944 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1791  preprotein translocase, SecA subunit  35.23 
 
 
958 aa  510  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29973  normal  0.0159583 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  35.52 
 
 
936 aa  509  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1598  preprotein translocase, SecA subunit  37.89 
 
 
850 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.142886 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  35.1 
 
 
936 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0511  preprotein translocase subunit SecA  37.16 
 
 
946 aa  502  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0299  preprotein translocase subunit SecA  36.33 
 
 
946 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0485  preprotein translocase subunit SecA  35.02 
 
 
951 aa  498  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1643  preprotein translocase, SecA subunit  34.92 
 
 
998 aa  493  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1478  preprotein translocase, SecA subunit  34.99 
 
 
970 aa  486  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.301651  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14700  protein translocase subunit secA  36.5 
 
 
911 aa  479  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.248111  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3078  preprotein translocase subunit SecA  44.89 
 
 
873 aa  473  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000716555  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2080  preprotein translocase subunit SecA  48.54 
 
 
903 aa  472  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  47.49 
 
 
872 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30890  preprotein translocase subunit SecA  45.91 
 
 
955 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164673  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2050  preprotein translocase subunit SecA  46.72 
 
 
897 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0121176  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2490  preprotein translocase subunit SecA  48.92 
 
 
968 aa  459  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.801958  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1999  preprotein translocase, SecA subunit  34.38 
 
 
920 aa  457  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.974197  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2553  preprotein translocase, SecA subunit  44.7 
 
 
796 aa  457  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  46.53 
 
 
899 aa  456  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0767  preprotein translocase subunit SecA  49.02 
 
 
994 aa  456  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.42226  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  46.23 
 
 
836 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6305  preprotein translocase subunit SecA  45.41 
 
 
975 aa  453  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507355  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5295  preprotein translocase subunit SecA  45.24 
 
 
835 aa  450  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5650  preprotein translocase subunit SecA  45.04 
 
 
835 aa  450  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000356308 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5038  preprotein translocase subunit SecA  45.24 
 
 
835 aa  452  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4868  preprotein translocase subunit SecA  45.24 
 
 
835 aa  451  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4883  preprotein translocase subunit SecA  45.24 
 
 
835 aa  451  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638638  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5352  preprotein translocase subunit SecA  45.24 
 
 
835 aa  451  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  44.19 
 
 
845 aa  452  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  46.21 
 
 
897 aa  449  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1387  preprotein translocase subunit SecA  47.96 
 
 
947 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.606945  normal  0.598179 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5421  preprotein translocase subunit SecA  45.24 
 
 
835 aa  452  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  43.6 
 
 
886 aa  450  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5277  preprotein translocase subunit SecA  45.24 
 
 
835 aa  451  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000840877 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1353  preprotein translocase subunit SecA  47.96 
 
 
947 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0722843  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3607  preprotein translocase, SecA subunit  46.18 
 
 
890 aa  452  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  47.13 
 
 
834 aa  451  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1371  preprotein translocase subunit SecA  47.96 
 
 
947 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.719275 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  46.34 
 
 
894 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4982  preprotein translocase subunit SecA  45.44 
 
 
835 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5307  preprotein translocase subunit SecA  45.04 
 
 
835 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1762  preprotein translocase subunit SecA  48.5 
 
 
938 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.263265 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  46.64 
 
 
836 aa  443  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  45.9 
 
 
866 aa  445  1e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>