More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_8810 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_8810  DNA topoisomerase  100 
 
 
868 aa  1798    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.917921  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32265  predicted protein  40.48 
 
 
863 aa  608  9.999999999999999e-173  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142978  normal  0.982566 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47417  predicted protein  31.61 
 
 
1009 aa  343  8e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143888  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34564  DNA topoisomerase  33.44 
 
 
616 aa  327  5e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496706  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00400  DNA topoisomerase type I, putative  34.09 
 
 
828 aa  325  2e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.772015  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04555  DNA topoisomerase III (Eurofung)  34.06 
 
 
629 aa  318  4e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.755081  normal  0.215917 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33842  predicted protein  32.59 
 
 
641 aa  308  3e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0885  DNA topoisomerase  35.28 
 
 
631 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0843416  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  31.44 
 
 
780 aa  293  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  28.49 
 
 
855 aa  278  4e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1735  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  31.01 
 
 
604 aa  271  5e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.718005  hitchhiker  0.000823973 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1359  DNA topoisomerase  32.88 
 
 
602 aa  260  7e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.013738 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0392  DNA topoisomerase  32.05 
 
 
604 aa  259  1e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.225119  normal  0.175863 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0109  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  33.28 
 
 
610 aa  256  2.0000000000000002e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000681889  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  32.46 
 
 
702 aa  252  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1115  DNA topoisomerase  33.5 
 
 
596 aa  251  5e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  30.98 
 
 
931 aa  245  3e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  28.21 
 
 
747 aa  244  3.9999999999999997e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  29.03 
 
 
849 aa  232  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  28.78 
 
 
942 aa  231  4e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  28.22 
 
 
744 aa  231  5e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  28.85 
 
 
844 aa  227  7e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  28.69 
 
 
837 aa  227  9e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  27.53 
 
 
827 aa  226  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  27.66 
 
 
864 aa  222  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  27.69 
 
 
935 aa  219  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  26.56 
 
 
843 aa  216  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  29.36 
 
 
931 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  25.78 
 
 
771 aa  213  9e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  26.82 
 
 
743 aa  211  4e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  27.22 
 
 
837 aa  210  7e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  27.38 
 
 
938 aa  209  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  26.59 
 
 
834 aa  206  2e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  27.95 
 
 
863 aa  204  4e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  26.07 
 
 
812 aa  160  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  26.52 
 
 
817 aa  160  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  27.01 
 
 
814 aa  159  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  27.4 
 
 
814 aa  154  5e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  26.73 
 
 
697 aa  146  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  24.12 
 
 
853 aa  146  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  26.62 
 
 
869 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  26.62 
 
 
869 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  26.62 
 
 
869 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  26.25 
 
 
693 aa  140  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  26.33 
 
 
780 aa  139  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1146  DNA topoisomerase I  27.7 
 
 
879 aa  138  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368466  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3876  DNA topoisomerase I  27.26 
 
 
876 aa  138  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198302  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3287  DNA topoisomerase I  27.43 
 
 
870 aa  138  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3514  DNA topoisomerase I  27.43 
 
 
869 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  25.93 
 
 
697 aa  137  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  26.45 
 
 
869 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  26.59 
 
 
691 aa  134  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  27.94 
 
 
868 aa  134  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3001  DNA topoisomerase III  26.43 
 
 
655 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514044  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1901  DNA topoisomerase I  25.49 
 
 
896 aa  133  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164413  normal  0.306298 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1889  DNA topoisomerase I  25.49 
 
 
668 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.806156  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1660  DNA topoisomerase I  24.92 
 
 
892 aa  133  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000915276  normal  0.794129 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2224  DNA topoisomerase I  26.24 
 
 
898 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.648811  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  25.56 
 
 
696 aa  131  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1712  DNA topoisomerase I  25.5 
 
 
911 aa  131  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583112  normal  0.397735 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  26.2 
 
 
868 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1585  DNA topoisomerase I  25.63 
 
 
894 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.328544  normal  0.0409432 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1660  DNA topoisomerase I  25.63 
 
 
894 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.367793  unclonable  0.0000368554 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02352  DNA topoisomerase I  27.62 
 
 
886 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.346512  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0393  DNA topoisomerase I  25.2 
 
 
884 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000925228  unclonable  0.0000000013775 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  26.2 
 
 
868 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2705  DNA topoisomerase I  25.09 
 
 
878 aa  129  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  25.17 
 
 
691 aa  129  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  25.17 
 
 
691 aa  129  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2437  DNA topoisomerase I  26.19 
 
 
936 aa  129  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0547767  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  24.22 
 
 
693 aa  129  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  25.6 
 
 
696 aa  128  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  27.06 
 
 
708 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0914  DNA topoisomerase I  26.86 
 
 
868 aa  128  4.0000000000000003e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002917  DNA topoisomerase III  24.36 
 
 
655 aa  127  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  25.62 
 
 
789 aa  127  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_002950  PG0104  DNA topoisomerase III  26.38 
 
 
675 aa  126  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000375285 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2250  DNA topoisomerase I  25.96 
 
 
880 aa  126  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5202  DNA topoisomerase III  25.22 
 
 
980 aa  126  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221506  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2496  DNA topoisomerase I  25.41 
 
 
880 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1853  DNA topoisomerase III  26.24 
 
 
695 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.989434  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1282  DNA topoisomerase I  26.22 
 
 
867 aa  126  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390974  normal  0.233625 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1729  DNA topoisomerase I  25.27 
 
 
894 aa  126  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0724746 
 
 
-
 
NC_002950  PG0754  DNA topoisomerase I  25.99 
 
 
788 aa  125  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1814  DNA topoisomerase III  26.51 
 
 
653 aa  125  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230615  normal  0.182925 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2489  DNA topoisomerase I  25.41 
 
 
880 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.297791  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1855  DNA topoisomerase I  25.41 
 
 
880 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000497797 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2609  DNA topoisomerase I  25.41 
 
 
880 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0281339  decreased coverage  0.00102405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  26.74 
 
 
868 aa  125  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  23.28 
 
 
691 aa  125  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  26.16 
 
 
836 aa  125  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3149  DNA topoisomerase I  26.7 
 
 
912 aa  124  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1322  DNA topoisomerase I  26.05 
 
 
872 aa  125  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425671  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03041  DNA topoisomerase III  24.32 
 
 
654 aa  124  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0738  DNA topoisomerase I  26.5 
 
 
978 aa  124  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2356  DNA topoisomerase I  26.47 
 
 
879 aa  124  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0613436  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  25.82 
 
 
729 aa  124  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000176541  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2328  DNA topoisomerase I  25.61 
 
 
895 aa  124  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.664503  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2693  DNA topoisomerase I  25.44 
 
 
813 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305019  normal  0.0402807 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2541  DNA topoisomerase III  26.07 
 
 
744 aa  123  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.111653  normal  0.0440835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>