29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_7988 on replicon NC_011701
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011701  PHATRDRAFT_7988  predicted protein  100 
 
 		 74 aa  157  6e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_3230  predicted protein  69.01 
 
 		 313 aa  110  5e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18895  normal  0.891214 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50442  predicted protein  63.89 
 
 		 196 aa  110  8.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.526697  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05690  ARF GTPase activator, putative  63.38 
 
 		 416 aa  105  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03190  ARF GTPase activator, putative  57.14 
 
 		 537 aa  97.1  7e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.074845  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06033  ARF GTPase activator (Glo3), putative (Eurofung)  56.52 
 
 		 496 aa  96.7  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30686  predicted protein  58.57 
 
 		 528 aa  96.3  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.837548 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30587  Zn finger-containing GTPase- Activating Protein for ARF  56.34 
 
 		 368 aa  94  6e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.930878  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02222  zinc finger protein gcs1 (AFU_orthologue; AFUA_5G07130)  52.78 
 
 		 422 aa  93.2  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0869741  normal  0.29351 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65149  GTP-ase activating protein for Arf  53.52 
 
 		 473 aa  90.1  8e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.150511  normal  0.859506 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47899  predicted protein  53.52 
 
 		 198 aa  88.6  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83616  zinc finger protein  53.42 
 
 		 370 aa  86.3  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.511867  normal  0.153049 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43597  predicted protein  52.05 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.268453 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21791  predicted protein  47.06 
 
 		 208 aa  83.6  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0609833  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01931  stromal membrane-associated protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07830)  47.95 
 
 		 565 aa  82.8  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.283365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23957  predicted protein  49.3 
 
 		 431 aa  80.5  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.502271  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04680  conserved hypothetical protein  44.44 
 
 		 438 aa  78.2  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01270  conserved hypothetical protein  45.57 
 
 		 1175 aa  77.4  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00191487  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01629  GTPase activating protein for Arf, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09120)  46.38 
 
 		 621 aa  77.4  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07950  conserved hypothetical protein  45.59 
 
 		 416 aa  75.9  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.893063  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27255  predicted protein  47.14 
 
 		 622 aa  75.1  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0830887 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29655  predicted protein  47.14 
 
 		 622 aa  75.1  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.233661  normal  0.159292 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_8461  predicted protein  65.31 
 
 		 53 aa  73.6  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0505148  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9123  predicted protein  59.18 
 
 		 52 aa  70.1  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04274  ARF GTPase activator (Csx2), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03790)  40 
 
 		 1113 aa  63.5  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.200938  normal  0.10616 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48638  GTPase activating protein  33.8 
 
 		 965 aa  60.8  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0963315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90941  protein (LSR1 protein)  32.88 
 
 		 444 aa  51.6  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.225966  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42776  predicted protein  32.31 
 
 		 976 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.161289  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30703  predicted protein  27.27 
 
 		 570 aa  41.2  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.255463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>