More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_56471 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  100 
 
 		 105 aa  218  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  58.42 
 
 		 105 aa  128  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  48.04 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37753  predicted protein  56.32 
 
 		 101 aa  105  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0200499  hitchhiker  0.00126408 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  43 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  47.12 
 
 		 104 aa  100  5e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  43 
 
 		 129 aa  99.4  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  49.4 
 
 		 189 aa  92  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  50 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  43.01 
 
 		 135 aa  88.2  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  42.16 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  44.34 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01639  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09090)  41.35 
 
 		 330 aa  84.7  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  42.55 
 
 		 138 aa  83.6  9e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  46.99 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  52 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  41.58 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  44.83 
 
 		 272 aa  81.6  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  41.76 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  39.42 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  45.57 
 
 		 310 aa  80.1  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56521  predicted protein  34.62 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  38.78 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46280  thioredoxin f  41.11 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767302  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  39.6 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  50.67 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  43.53 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  40 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  41.57 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  46.48 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  43.42 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  37.89 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  46.84 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  43.48 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  44.05 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0788  thioredoxin  35.71 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9576  predicted protein  40.45 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  47.95 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  42.7 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  36.63 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  43.66 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  39.39 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0218  thioredoxin  35.05 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  51.43 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  51.43 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  39.78 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  42 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  43.02 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  41.9 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2236  thioredoxin  37.14 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.773662  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  39.39 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  43.18 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  43.04 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  39.39 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  38.78 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  38.04 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  39.08 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  45.57 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  43.01 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  45.07 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  40.22 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  38.2 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  42.11 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  41.89 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  39.44 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  43.84 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  42.17 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  43.53 
 
 		 277 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  45.07 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0187  thioredoxin  39.8 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849594 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  42.47 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  40 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  38.68 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  43.68 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  45.07 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  38.57 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  41.98 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  43.66 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  45.24 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  45.07 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  36.05 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  42.86 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  40.7 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  39.77 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  43.37 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  45.07 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  42.5 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  42.25 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  36.05 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  38.64 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  39.6 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  36.05 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_56519  predicted protein  40.62 
 
 		 700 aa  73.2  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.532885  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  40.85 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  37.35 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  44.59 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  43.75 
 
 		 293 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  39.44 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  42.11 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  39.53 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>