15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54992 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_54992  predicted protein  100 
 
 		 458 aa  945    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030257  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03033  DNA primase subunit Pri1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09020)  39.63 
 
 		 521 aa  306  6e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.344659 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01650  conserved hypothetical protein  40 
 
 		 429 aa  296  7e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41816  predicted protein  40.33 
 
 		 398 aa  272  8.000000000000001e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.251296 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_48208  predicted protein  40.33 
 
 		 398 aa  272  8.000000000000001e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.180067 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55030  p48 polypeptide of DNA primase  36.45 
 
 		 437 aa  271  2e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0882  putative DNA primase, small subunit  23.86 
 
 		 364 aa  52.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506684  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2753  DNA primase small subunit  24.23 
 
 		 386 aa  46.6  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0410  DNA primase, small subunit  24.55 
 
 		 391 aa  45.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2482  DNA primase, small subunit  26.43 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  24.27 
 
 		 1188 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0991  DNA primase small subunit  25.15 
 
 		 312 aa  44.3  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0420  DNA primase small subunit  26.75 
 
 		 395 aa  43.5  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.669616  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0622  putative DNA primase, small subunit  23.78 
 
 		 389 aa  43.5  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1378  putative DNA primase, small subunit  25.81 
 
 		 348 aa  43.5  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214397  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>