280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54842 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  100 
 
 
595 aa  1233    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  46.68 
 
 
512 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  45.88 
 
 
512 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  45 
 
 
515 aa  438  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  46.41 
 
 
512 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  43.34 
 
 
554 aa  384  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  39.41 
 
 
509 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  40.6 
 
 
497 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  37.1 
 
 
509 aa  358  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  40.2 
 
 
497 aa  356  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  39.47 
 
 
509 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  36.35 
 
 
509 aa  354  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  39.25 
 
 
509 aa  352  8.999999999999999e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  39.84 
 
 
511 aa  352  1e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  41.12 
 
 
513 aa  350  3e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  36.72 
 
 
509 aa  350  5e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  38.31 
 
 
598 aa  347  3e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  39.48 
 
 
506 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  40.43 
 
 
502 aa  340  2.9999999999999998e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  40.9 
 
 
516 aa  338  1.9999999999999998e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  38.69 
 
 
510 aa  332  2e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  38.4 
 
 
645 aa  329  9e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51868  carotenoid isomerase  36.1 
 
 
633 aa  308  2.0000000000000002e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  38.21 
 
 
530 aa  307  3e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  38.03 
 
 
504 aa  303  6.000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54826  carotenoid isomerase  34.26 
 
 
635 aa  236  8e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698106  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  31.17 
 
 
516 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 
532 aa  206  9e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  30.26 
 
 
520 aa  206  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  30.75 
 
 
518 aa  205  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  29.13 
 
 
514 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  30.76 
 
 
512 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  30.76 
 
 
512 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  29.87 
 
 
520 aa  200  6e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  29.69 
 
 
514 aa  200  6e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  29.64 
 
 
506 aa  199  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  30.43 
 
 
518 aa  199  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  29.1 
 
 
514 aa  198  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  29.76 
 
 
508 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  27.9 
 
 
514 aa  197  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  31.14 
 
 
506 aa  196  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  28.6 
 
 
520 aa  191  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  27.97 
 
 
522 aa  178  3e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  28.02 
 
 
503 aa  176  8e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  27.31 
 
 
503 aa  176  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  29.38 
 
 
504 aa  175  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  28.49 
 
 
507 aa  172  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  27.38 
 
 
508 aa  170  5e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  27.8 
 
 
503 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  26.38 
 
 
505 aa  148  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  26.12 
 
 
938 aa  118  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 
501 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.95 
 
 
740 aa  105  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  26.93 
 
 
504 aa  100  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  25.93 
 
 
499 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 
547 aa  95.9  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  25.61 
 
 
499 aa  95.5  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  24.91 
 
 
493 aa  93.6  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  26.65 
 
 
505 aa  92  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  23.35 
 
 
510 aa  91.3  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  26.67 
 
 
523 aa  89.7  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  25.28 
 
 
499 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  25.81 
 
 
510 aa  87  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  24.43 
 
 
498 aa  86.3  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  25.29 
 
 
708 aa  84.7  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  24.85 
 
 
711 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
565 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  27.82 
 
 
489 aa  82.4  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 
717 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  23.12 
 
 
511 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 
520 aa  81.6  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  23.7 
 
 
504 aa  80.9  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  24.82 
 
 
564 aa  80.9  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  23.81 
 
 
507 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  23.18 
 
 
512 aa  80.1  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  24.29 
 
 
535 aa  79.7  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  23.85 
 
 
511 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  24.51 
 
 
556 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  22.93 
 
 
492 aa  78.6  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  22.92 
 
 
494 aa  78.6  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  22.52 
 
 
492 aa  78.2  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  24.72 
 
 
517 aa  77.8  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
722 aa  77.4  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03825  hypothetical protein  22.73 
 
 
508 aa  77  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  23.12 
 
 
508 aa  77  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  22.72 
 
 
563 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  23.6 
 
 
496 aa  77  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  24.57 
 
 
508 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  24.82 
 
 
518 aa  77  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  22.76 
 
 
505 aa  74.7  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  23.87 
 
 
547 aa  75.1  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  23.74 
 
 
522 aa  74.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  24.01 
 
 
497 aa  74.3  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 
520 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  24.09 
 
 
512 aa  73.9  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  24.82 
 
 
494 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  24.73 
 
 
554 aa  73.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  24.39 
 
 
519 aa  72.4  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1385  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 
492 aa  72.8  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0115639 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  22.16 
 
 
484 aa  72  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>