44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_5423 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_5423  predicted protein  100 
 
 
226 aa  472  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01170  thiamine pyrophosphokinase, putative  35.53 
 
 
229 aa  123  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.772914  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12109  predicted protein  34.8 
 
 
247 aa  97.4  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.197387  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59866  Thiamine pyrophosphokinase (TPK) (Thiamine kinase)  28.62 
 
 
333 aa  92.4  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.324549 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1805  thiamine pyrophosphokinase  26.44 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.219265  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0426  thiamine pyrophosphokinase  28.1 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2483  thiamine pyrophosphokinase  23.33 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0789  hypothetical protein  27.38 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10040  thiamine pyrophosphokinase  27.27 
 
 
215 aa  61.6  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3176  thiamine pyrophosphokinase  27.01 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0577  thiamine pyrophosphokinase  25.93 
 
 
212 aa  58.5  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0627  thiamine pyrophosphokinase  27.89 
 
 
219 aa  58.5  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3421  thiamine pyrophosphokinase  25.89 
 
 
212 aa  58.2  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1746  thiamine pyrophosphokinase  26.43 
 
 
211 aa  58.2  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511676  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4124  thiamine pyrophosphokinase  22.87 
 
 
207 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.738174  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1282  hypothetical protein  26.56 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0360519  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3682  thiamine pyrophosphokinase  24.47 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000180795  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1307  hypothetical protein  26.56 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00543871  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2739  putative thiamine pyrophosphokinase  27.55 
 
 
229 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.641586  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1795  thiamine pyrophosphokinase  23.4 
 
 
216 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000771119  normal  0.210862 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1225  thiamine pyrophosphokinase  24.61 
 
 
230 aa  52.8  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3607  thiamine pyrophosphokinase  23.81 
 
 
224 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.945813 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1147  thiamine pyrophosphokinase  22.9 
 
 
205 aa  51.6  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.514296  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2564  hypothetical protein  23.65 
 
 
217 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1538  thiamine pyrophosphokinase  27.46 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1966  thiamine pyrophosphokinase  28.21 
 
 
223 aa  49.7  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.923392  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0039  thiamine pyrophosphokinase  26.32 
 
 
202 aa  48.9  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000099633  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0039  thiamine pyrophosphokinase  26.32 
 
 
202 aa  48.9  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0480  hypothetical protein  25.7 
 
 
230 aa  47.8  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3933  thiamine pyrophosphokinase  28.87 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1253  thiamine pyrophosphokinase  25.57 
 
 
222 aa  47.8  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2418  hypothetical protein  23.65 
 
 
217 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2511  thiamine pyrophosphokinase  25.53 
 
 
213 aa  46.6  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000001941  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3901  hypothetical protein  24.47 
 
 
213 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000344688  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2104  thiamine pyrophosphokinase  30 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3958  thiamine pyrophosphokinase  24.34 
 
 
213 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00188574  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4449  thiamine pyrophosphokinase  24.86 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359554  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3907  thiamine pyrophosphokinase  24.47 
 
 
213 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000037625  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0906  thiamine pyrophosphokinase  24.65 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000103792  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0036  thiamine pyrophosphokinase  22.12 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000794456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1285  thiamine pyrophosphokinase  24.34 
 
 
219 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000567984  hitchhiker  0.0000616024 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3618  thiamine pyrophosphokinase  24.34 
 
 
213 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000017674  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0363  hypothetical protein  24.88 
 
 
232 aa  42  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2007  thiamine pyrophosphokinase  24.87 
 
 
232 aa  42  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0983974  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>