30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_52750 on replicon NC_011699
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011699  PHATRDRAFT_52750  ubiquitin-protein ligase 1  100 
 
 		 166 aa  339  9e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01260  ubiquitin-protein ligase, putative  38.1 
 
 		 3251 aa  101  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01966  ubiquitin-protein ligase (Tom1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10780)  35.14 
 
 		 4022 aa  93.6  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.581639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52147  predicted protein  33.1 
 
 		 406 aa  90.9  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41898  predicted protein  33.1 
 
 		 406 aa  90.9  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12562  predicted protein  31.47 
 
 		 384 aa  85.9  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.637847  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03999  IQ and HECT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04210)  36 
 
 		 1222 aa  84.3  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.169282 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65602  predicted protein  29.05 
 
 		 776 aa  79  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.62617  normal  0.190036 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83187  ubiquitin-protein ligase (E3)  38.57 
 
 		 977 aa  78.2  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.346459  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01339  ubiquitin-protein ligase (Rsp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09500)  29.93 
 
 		 821 aa  77.4  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00220  ubiquitin-protein ligase, putative  30.61 
 
 		 833 aa  76.6  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.311807  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_42123  predicted protein  34.44 
 
 		 343 aa  74.3  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66630  predicted protein  34.9 
 
 		 950 aa  73.9  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.214435 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81688  E3 ubiquitin protein ligase TOM1 (Temperature dependent-organization in mitotic nucleus protein 1)  28.57 
 
 		 3268 aa  72.8  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.325065 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14843  predicted protein  30.43 
 
 		 283 aa  70.9  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01874  HECT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G04450)  32.17 
 
 		 1146 aa  69.3  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32908  ubiquitin--protein ligase  35.14 
 
 		 1702 aa  67.8  0.00000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0606502  normal  0.132207 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38506  predicted protein  31.97 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41776  predicted protein  28.95 
 
 		 376 aa  65.9  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.282531  normal  0.383918 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36723  predicted protein  28.95 
 
 		 376 aa  65.9  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00193554 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01540  hypothetical protein  33.1 
 
 		 1063 aa  64.3  0.0000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14177  predicted protein  33.1 
 
 		 370 aa  62.4  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.324881  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39499  predicted protein  29.22 
 
 		 520 aa  58.9  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00243208 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14345  predicted protein  31.62 
 
 		 367 aa  58.2  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15627  predicted protein  30.71 
 
 		 315 aa  57.8  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.254802  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03680  conserved hypothetical protein  29.5 
 
 		 1843 aa  53.9  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.421578  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43113  predicted protein  30.2 
 
 		 443 aa  53.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.021277  hitchhiker  0.00922136 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31158  predicted protein  24.66 
 
 		 781 aa  50.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000507428  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01746  ubiquitin-protein ligase Ufd4, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08880)  28.38 
 
 		 1820 aa  48.5  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0719286  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00444  ubiquitin-protein ligase (Hul4), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04640)  28.68 
 
 		 1090 aa  41.6  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.358914  normal  0.139681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>