More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_52655 on replicon NC_011694
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011694  PHATRDRAFT_52655  glutamyl-trna synthase  100 
 
 
588 aa  1216    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.233509  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  48.69 
 
 
546 aa  462  9.999999999999999e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 
482 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 
485 aa  375  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
485 aa  365  1e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
488 aa  365  2e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 
485 aa  363  7.0000000000000005e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 
494 aa  362  1e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 
478 aa  359  9e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  39.8 
 
 
495 aa  357  3.9999999999999996e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 
481 aa  350  3e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 
501 aa  350  5e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 
479 aa  350  6e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  39.28 
 
 
490 aa  348  1e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 
490 aa  347  3e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
488 aa  346  6e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 
469 aa  339  7e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 
467 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 
490 aa  338  9.999999999999999e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 
469 aa  337  3.9999999999999995e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 
466 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 
486 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 
465 aa  334  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 
495 aa  332  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 
496 aa  332  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 
491 aa  331  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
466 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 
467 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
466 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
473 aa  327  5e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
465 aa  325  1e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 
491 aa  325  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 
469 aa  325  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 
504 aa  324  3e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 
477 aa  323  4e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
466 aa  323  4e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 
467 aa  323  7e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1728  glutamyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 
469 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000433955  normal  0.283148 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1365  glutamyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 
469 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000124879  normal  0.0325353 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1430  glutamyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 
469 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 
469 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000145575  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
469 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
469 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 
480 aa  320  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 
470 aa  320  3e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2499  glutamyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
469 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000172182  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 
484 aa  320  5e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 
484 aa  320  5e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
471 aa  320  6e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 
484 aa  318  1e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
470 aa  318  1e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 
472 aa  319  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 
485 aa  318  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
463 aa  318  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 
492 aa  318  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 
469 aa  317  3e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2906  glutamyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
469 aa  317  4e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000836575  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 
467 aa  316  6e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 
468 aa  316  6e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 
469 aa  317  6e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000565413  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 
480 aa  316  9e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 
469 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
471 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 
468 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
492 aa  314  2.9999999999999996e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
488 aa  314  2.9999999999999996e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
471 aa  314  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
471 aa  314  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2714  glutamyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
469 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 
509 aa  313  3.9999999999999997e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2802  glutamyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
469 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000260001  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1554  glutamyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
469 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000003282  normal  0.0351282 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2822  glutamyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
469 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000059188  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2947  glutamyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
469 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000528448  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 
494 aa  313  7.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 
464 aa  312  1e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
471 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
471 aa  311  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 
491 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
471 aa  311  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
475 aa  311  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  48.5 
 
 
471 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
471 aa  311  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
471 aa  311  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
464 aa  311  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
471 aa  311  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
471 aa  311  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
471 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3084  glutamyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
471 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00745356  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  37.57 
 
 
518 aa  311  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 
475 aa  310  4e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 
472 aa  310  5e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 
470 aa  310  5.9999999999999995e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 
483 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
471 aa  309  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000633167  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
471 aa  309  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
471 aa  309  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
471 aa  309  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 
472 aa  309  9e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 
488 aa  309  9e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>