209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_5235 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_5235  predicted protein  100 
 
 		 263 aa  548  1e-155  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540131  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  48.39 
 
 		 241 aa  241  7e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10848  predicted protein  35.41 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11563  predicted protein  36.73 
 
 		 238 aa  163  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684972  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82287  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit)  34.6 
 
 		 441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.770378 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05510  cAMP-dependent protein kinase inhibitor, putative  30.74 
 
 		 482 aa  134  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04987  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O59922]  29 
 
 		 412 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.599779  normal  0.51731 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12655  predicted protein  28.52 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12211  predicted protein  31.22 
 
 		 528 aa  103  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.58 
 
 		 146 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  34.91 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  31.86 
 
 		 160 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0840  cyclic nucleotide-binding protein  33.98 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.126759 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.78 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  30.33 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  29.46 
 
 		 225 aa  62  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 224 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 224 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  28.83 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.91 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  28.04 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.83 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3842  cyclic nucleotide-binding protein  28.46 
 
 		 582 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  30.84 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3549  cyclic nucleotide-binding protein  28.46 
 
 		 582 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.864417 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  29.36 
 
 		 413 aa  55.8  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4039  cyclic nucleotide-binding protein  27.5 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17311  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  26.89 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.08 
 
 		 1056 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 		 157 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0866  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 		 546 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.100369 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  29.25 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63653  Leucine rich repeat protein, contains F-box  21.54 
 
 		 868 aa  53.5  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.422768  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  24.31 
 
 		 482 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1433  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.43 
 
 		 408 aa  53.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  29.2 
 
 		 948 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27248  predicted protein  23.86 
 
 		 680 aa  53.5  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.2735 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29662  predicted protein  23.86 
 
 		 680 aa  53.5  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.226582  normal  0.0425728 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2230  hypothetical protein  34.04 
 
 		 356 aa  52.8  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323716 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 230 aa  53.1  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 231 aa  52.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  27.78 
 
 		 628 aa  52.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7320  cyclic nucleotide-binding protein  27 
 
 		 169 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5013  cyclic nucleotide-binding protein  29.25 
 
 		 147 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.32822  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6450  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.53 
 
 		 253 aa  52.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.45 
 
 		 225 aa  52.4  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1926  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.59 
 
 		 168 aa  52  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  27.94 
 
 		 388 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3539  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 		 857 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0290793  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  28 
 
 		 226 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3891  cyclic nucleotide-binding protein  29.75 
 
 		 155 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3910  cyclic nucleotide-binding protein  29.2 
 
 		 167 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.175845 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  24.66 
 
 		 449 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1772  cyclic nucleotide-binding protein  23.97 
 
 		 161 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.47 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  28.97 
 
 		 417 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.21 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  27.55 
 
 		 482 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3468  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.96 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  37.65 
 
 		 388 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.52 
 
 		 224 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4099  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 237 aa  50.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000655046 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.53 
 
 		 228 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  26 
 
 		 226 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.4 
 
 		 222 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 236 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1866  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.12 
 
 		 182 aa  49.3  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  26.53 
 
 		 230 aa  49.3  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2896  cyclic nucleotide-binding  26.42 
 
 		 194 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  26.42 
 
 		 149 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.22 
 
 		 234 aa  49.3  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 231 aa  49.3  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 231 aa  49.3  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3122  cyclic nucleotide-binding protein  26.42 
 
 		 149 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.69 
 
 		 171 aa  48.9  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1177  cyclic nucleotide-binding  27.36 
 
 		 463 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.706257  normal  0.0435994 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  28.97 
 
 		 224 aa  48.9  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1780  cyclic nucleotide-binding protein  26.36 
 
 		 156 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2455  cyclic nucleotide-binding protein  27.52 
 
 		 594 aa  48.9  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0426  Na+/H+ antiporter  28.57 
 
 		 832 aa  48.9  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2082  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 832 aa  48.9  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.584605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  27.97 
 
 		 832 aa  48.9  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  27.21 
 
 		 637 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.71 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1243  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.42 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00145976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1291  cyclic nucleotide-binding protein  27.43 
 
 		 164 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.234039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  25 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>