111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_51691 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  100 
 
 		 225 aa  462  1e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  54.69 
 
 		 213 aa  220  9.999999999999999e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  51.98 
 
 		 233 aa  218  3.9999999999999997e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  50.76 
 
 		 217 aa  210  1e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  50.25 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  46.04 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  39.78 
 
 		 187 aa  124  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  35.39 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  29.74 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  32.64 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  32.98 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  29.63 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  30.61 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  30.1 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  32.43 
 
 		 297 aa  95.9  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  29.63 
 
 		 272 aa  93.6  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  29.65 
 
 		 282 aa  93.6  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  30.69 
 
 		 283 aa  94  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  28.71 
 
 		 303 aa  92.8  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  31.61 
 
 		 203 aa  92.4  5e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  28.57 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  30.57 
 
 		 203 aa  89  6e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  28.12 
 
 		 219 aa  89  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  28.12 
 
 		 219 aa  89  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  28.04 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  29.5 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  30 
 
 		 197 aa  88.2  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  30.69 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  27.89 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  29.1 
 
 		 301 aa  86.3  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  30 
 
 		 206 aa  85.9  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  30.09 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  30.05 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  27.37 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  29.78 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  26.04 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  29.31 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.89 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  27.72 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  31.58 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  29.02 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.96 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  29.65 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  26.44 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  27 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  27.46 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  26.46 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  26.96 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  28.57 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14571  predicted protein  29.17 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  29.71 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  25.53 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  28.64 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  28.34 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  25.95 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  26.32 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  25.24 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  24.15 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2244  20S proteasome, A and B subunits  26.64 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.43 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  26.82 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  26.56 
 
 		 290 aa  58.5  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1832  proteasome endopeptidase complex  25 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  28.9 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  26.77 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  25.48 
 
 		 284 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5871  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  24.62 
 
 		 282 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  23.5 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  25.27 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  24.59 
 
 		 273 aa  52  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  27.78 
 
 		 243 aa  51.6  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  26.22 
 
 		 304 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  27.53 
 
 		 272 aa  51.2  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  27.84 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  25.71 
 
 		 249 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  23.35 
 
 		 302 aa  49.3  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  23.7 
 
 		 259 aa  49.3  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  25.63 
 
 		 288 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  24.43 
 
 		 238 aa  48.5  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  23.7 
 
 		 259 aa  48.5  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03493  conserved hypothetical protein  24.35 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05784  putative proteasome core component, beta 6 subunit (Eurofung)  20.36 
 
 		 261 aa  47.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109693  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03730  proteasome subunit beta type 3, putative  21.67 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  23.46 
 
 		 270 aa  47  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  23.7 
 
 		 259 aa  47  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  28.98 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  23.7 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  22.16 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1873  20S proteasome A and B subunits  25.87 
 
 		 302 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.801256 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02950  endopeptidase, putative  22.77 
 
 		 280 aa  45.8  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0631891  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2645  proteasome subunit beta  26.15 
 
 		 283 aa  45.8  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  26.59 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  23.43 
 
 		 271 aa  45.4  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  26.43 
 
 		 274 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2969  20S proteasome A and B subunits  25.84 
 
 		 288 aa  45.4  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000842797  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01080  hypothetical protein  22.67 
 
 		 272 aa  45.1  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  24.57 
 
 		 263 aa  44.3  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  25 
 
 		 268 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55763  predicted protein  20 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>