More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_51298 on replicon NC_011699
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011699  PHATRDRAFT_51298  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 306 aa  634    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33839  predicted protein  61.09 
 
 		 282 aa  329  4e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  59.52 
 
 		 249 aa  320  9.999999999999999e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  60.71 
 
 		 247 aa  318  9e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  62.92 
 
 		 270 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  62.5 
 
 		 248 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  62.5 
 
 		 248 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  63.33 
 
 		 248 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  59 
 
 		 270 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0635  phosphoglyceromutase  59.29 
 
 		 249 aa  309  4e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00161854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  58.27 
 
 		 248 aa  308  5e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  61.67 
 
 		 249 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  61.67 
 
 		 249 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  61.67 
 
 		 249 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  61.67 
 
 		 249 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  61.67 
 
 		 249 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  61.67 
 
 		 249 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  61.67 
 
 		 249 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  62.08 
 
 		 248 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  58.73 
 
 		 247 aa  308  6.999999999999999e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  61.76 
 
 		 270 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  62.5 
 
 		 248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  61.76 
 
 		 270 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  56.75 
 
 		 247 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  57.94 
 
 		 251 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  61.76 
 
 		 248 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  60.92 
 
 		 247 aa  304  1.0000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  58.73 
 
 		 248 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  56.75 
 
 		 247 aa  301  6.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  60.42 
 
 		 250 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  57.48 
 
 		 249 aa  300  2e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  57.54 
 
 		 247 aa  299  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  57.87 
 
 		 248 aa  299  4e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  58.33 
 
 		 436 aa  297  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1450  phosphoglyceromutase  56.92 
 
 		 249 aa  295  6e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0421206  normal  0.072339 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  56.86 
 
 		 267 aa  293  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  59.66 
 
 		 247 aa  293  2e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  57.5 
 
 		 250 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  57.5 
 
 		 250 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  57.92 
 
 		 250 aa  293  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  57.5 
 
 		 250 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  55.86 
 
 		 293 aa  292  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  57.08 
 
 		 250 aa  292  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  57.08 
 
 		 250 aa  292  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  57.38 
 
 		 251 aa  291  8e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  57.38 
 
 		 251 aa  291  8e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  57.5 
 
 		 250 aa  290  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  57.5 
 
 		 250 aa  290  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  57.5 
 
 		 250 aa  290  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  57.5 
 
 		 250 aa  290  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  57.5 
 
 		 250 aa  290  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  57.5 
 
 		 250 aa  290  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  57.5 
 
 		 250 aa  290  1e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  57.5 
 
 		 250 aa  290  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  56.13 
 
 		 247 aa  290  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  57.08 
 
 		 250 aa  289  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  57.08 
 
 		 250 aa  288  7e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  57.08 
 
 		 248 aa  288  8e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1052  phosphoglyceromutase  55.38 
 
 		 246 aa  287  2e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0445459  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  56.67 
 
 		 250 aa  287  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  57.08 
 
 		 250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  55.83 
 
 		 250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  53.54 
 
 		 248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  55 
 
 		 250 aa  282  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1407  phosphoglyceromutase  55.83 
 
 		 250 aa  281  7.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2861  phosphoglyceromutase  55.83 
 
 		 250 aa  281  7.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2948  phosphoglyceromutase  55.83 
 
 		 250 aa  281  7.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  58.93 
 
 		 251 aa  281  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3765  phosphoglycerate mutase  56.76 
 
 		 240 aa  278  8e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  56.72 
 
 		 247 aa  278  8e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2293  phosphoglyceromutase  57.66 
 
 		 245 aa  278  8e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120355  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  58.93 
 
 		 234 aa  276  4e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2442  phosphoglyceromutase  57.21 
 
 		 245 aa  276  4e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.205182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2520  phosphoglyceromutase  57.21 
 
 		 245 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000915293  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2583  phosphoglyceromutase  56.76 
 
 		 245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000223662  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  56.25 
 
 		 250 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2281  phosphoglyceromutase  56.31 
 
 		 245 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000568888  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  54.62 
 
 		 253 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0772  phosphoglycerate mutase 1 family  53.39 
 
 		 601 aa  272  5.000000000000001e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2234  phosphoglyceromutase  56.31 
 
 		 245 aa  272  6e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2893  phosphoglyceromutase  56.31 
 
 		 245 aa  270  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00820625  normal  0.311861 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  55.46 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  54.2 
 
 		 247 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  53.15 
 
 		 248 aa  269  4e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2313  phosphoglyceromutase  56.31 
 
 		 245 aa  269  5e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.479703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2488  phosphoglyceromutase  56.31 
 
 		 245 aa  269  5e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2509  phosphoglyceromutase  56.31 
 
 		 245 aa  269  5e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.805366 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  57.66 
 
 		 234 aa  268  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1653  phosphoglyceromutase  54.5 
 
 		 229 aa  268  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  54.2 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0287  phosphoglyceromutase  51.98 
 
 		 248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0130  phosphoglyceromutase  51.59 
 
 		 248 aa  266  4e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296259 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  54.2 
 
 		 232 aa  266  4e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  53.57 
 
 		 247 aa  265  5e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03720  phosphoglycerate mutase  55.86 
 
 		 252 aa  265  5e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00729363  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  57.08 
 
 		 248 aa  265  5.999999999999999e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  51.78 
 
 		 253 aa  265  5.999999999999999e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4338  phosphoglycerate mutase 1 family  52.57 
 
 		 248 aa  265  7e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  54.62 
 
 		 247 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  52.78 
 
 		 249 aa  264  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>