227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_51283 on replicon NC_011697
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011697  PHATRDRAFT_51283  predicted protein  100 
 
 
328 aa  653    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38809  predicted protein  52.25 
 
 
319 aa  238  1e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000594517  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04610  conserved hypothetical protein  50.46 
 
 
304 aa  228  7e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06501  splicing factor 3b subunit 4 (AFU_orthologue; AFUA_6G05180)  47.91 
 
 
352 aa  210  3e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84754  predicted protein  40.47 
 
 
246 aa  167  2.9999999999999998e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.345333 
 
 
-
 
NC_006686  CND05240  mRNA catabolism, nonsense-mediated-related protein, putative  37.5 
 
 
434 aa  109  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115659  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01160  polyadenylate-binding protein, putative  33.53 
 
 
673 aa  104  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  34.09 
 
 
732 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.175791 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  30.23 
 
 
477 aa  95.9  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  31.21 
 
 
605 aa  94  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  34.13 
 
 
572 aa  89.4  9e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  35.43 
 
 
632 aa  85.5  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55837  predicted protein  28.65 
 
 
453 aa  83.2  0.000000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.876442  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  28.34 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68431  predicted protein  27.52 
 
 
481 aa  73.9  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.326918  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10941  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein HRP1 (AFU_orthologue; AFUA_2G06090)  25.97 
 
 
559 aa  68.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210274  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20857  predicted protein  27.27 
 
 
687 aa  66.2  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  27.55 
 
 
441 aa  63.5  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  39.77 
 
 
499 aa  63.5  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  34.88 
 
 
99 aa  62.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  29.51 
 
 
552 aa  62.8  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  36.9 
 
 
99 aa  62.4  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  26.46 
 
 
524 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34965  predicted protein  28.95 
 
 
194 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.89638 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1404  RNA-binding region RNP-1  35.06 
 
 
95 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.187524  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09090  Putative RNA binding proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARJ0]  26.88 
 
 
393 aa  60.1  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461764  normal  0.414423 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  38.67 
 
 
90 aa  60.1  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1645  RNA recognition motif-containing protein  36.36 
 
 
95 aa  60.1  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  36.36 
 
 
104 aa  59.7  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
104 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  35.56 
 
 
95 aa  59.3  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  36.05 
 
 
89 aa  59.3  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  36 
 
 
105 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
88 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  34.88 
 
 
94 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  40.74 
 
 
99 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  35.53 
 
 
196 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
88 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  37.8 
 
 
82 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  38.27 
 
 
104 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  34.88 
 
 
97 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  41.33 
 
 
122 aa  57  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  32.58 
 
 
207 aa  56.2  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  39.51 
 
 
134 aa  56.6  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  34.09 
 
 
97 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2980  RNP-1 like RNA-binding protein  37.33 
 
 
241 aa  56.2  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0728065  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06256  peptidyl prolyl cis-trans isomerase Cyclophilin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12990)  38.46 
 
 
153 aa  56.2  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218762  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_7602  predicted protein  31.52 
 
 
161 aa  55.8  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 
90 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  37.33 
 
 
90 aa  55.8  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  32.56 
 
 
98 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  32.89 
 
 
173 aa  55.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  32.56 
 
 
98 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  25.12 
 
 
838 aa  55.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  36 
 
 
90 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  40.74 
 
 
149 aa  55.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  40.74 
 
 
155 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45495  predicted protein  35.44 
 
 
155 aa  54.7  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal  0.923833 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  32.14 
 
 
96 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  37.8 
 
 
90 aa  54.7  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  33.7 
 
 
97 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  37.04 
 
 
95 aa  54.3  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  37.04 
 
 
455 aa  54.3  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  40.79 
 
 
81 aa  53.9  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  31.33 
 
 
102 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  34.52 
 
 
85 aa  54.3  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  36 
 
 
90 aa  53.5  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2498  RNA binding protein  38.36 
 
 
107 aa  53.9  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  33.75 
 
 
90 aa  53.9  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27365  predicted protein  27.32 
 
 
288 aa  53.5  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.60406  normal  0.0267412 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62299  predicted protein  27.32 
 
 
446 aa  53.9  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  39.51 
 
 
132 aa  53.9  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0338  RNA-binding protein  39.47 
 
 
160 aa  53.5  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  36.99 
 
 
182 aa  53.5  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  34.21 
 
 
250 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  39.47 
 
 
76 aa  53.5  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  34.21 
 
 
250 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10530  predicted protein  32.26 
 
 
103 aa  53.1  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02130  single-stranded nucleic acid binding protein, putative  34.18 
 
 
223 aa  53.1  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  34.21 
 
 
103 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0140  RNP-1-like RNA-binding protein  36.59 
 
 
152 aa  52.8  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0664394 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  37.33 
 
 
95 aa  53.1  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0802  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
89 aa  53.1  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209156 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2851  RNP-1 like RNA-binding protein  34.88 
 
 
97 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  34.21 
 
 
103 aa  52.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02989  glycine-rich RNA-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08580)  30.77 
 
 
128 aa  52.4  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0108473  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0321  hypothetical protein  34.72 
 
 
91 aa  52.8  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  38.82 
 
 
115 aa  52.8  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0980  RNA-binding region RNP-1  35.62 
 
 
81 aa  52.8  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.000651233  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  32.5 
 
 
90 aa  52.8  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  39.51 
 
 
176 aa  52.8  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 
94 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 
87 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  38.67 
 
 
87 aa  52  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  32.89 
 
 
202 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 
94 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
88 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  34.67 
 
 
90 aa  52  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 
99 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  39.51 
 
 
148 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>