More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_51277 on replicon NC_011697
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011697  PHATRDRAFT_51277  predicted protein  100 
 
 
373 aa  776    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29231  predicted protein  56.3 
 
 
374 aa  432  1e-120  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04080  GTP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05560)  57.62 
 
 
378 aa  422  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.256152 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81735  predicted protein  56.95 
 
 
367 aa  421  1e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  55.71 
 
 
368 aa  411  1e-113  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  50.66 
 
 
407 aa  375  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35696  predicted protein  51.72 
 
 
410 aa  369  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  50.4 
 
 
367 aa  362  5.0000000000000005e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  48.66 
 
 
367 aa  352  5e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  47.57 
 
 
368 aa  348  8e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  44.47 
 
 
367 aa  335  7e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  45.41 
 
 
363 aa  331  2e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  45.26 
 
 
364 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  43.36 
 
 
369 aa  316  4e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  45.87 
 
 
369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  45.87 
 
 
369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  44.2 
 
 
369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  45.04 
 
 
369 aa  297  2e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  41.22 
 
 
370 aa  295  1e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.71 
 
 
370 aa  292  5e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  42.44 
 
 
371 aa  290  2e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  41.55 
 
 
370 aa  289  7e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  40.96 
 
 
371 aa  288  9e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0958  small GTP-binding protein  40.32 
 
 
365 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  38.19 
 
 
370 aa  247  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0093  TGS domain-containing protein  38.14 
 
 
346 aa  241  1e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0617741  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  37.85 
 
 
369 aa  239  5.999999999999999e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  38.12 
 
 
368 aa  231  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  37.02 
 
 
370 aa  228  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  38.74 
 
 
371 aa  219  6e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1844  TGS domain-containing protein  25.67 
 
 
389 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0581  TGS domain-containing protein  25 
 
 
389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0697  TGS domain-containing protein  25.47 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0678  TGS domain-containing protein  26.44 
 
 
377 aa  104  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1670  TGS domain-containing protein  25.3 
 
 
387 aa  95.5  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00970961 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0982  TGS domain-containing protein  24.46 
 
 
380 aa  93.2  7e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.741056 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0662  TGS domain-containing protein  25.75 
 
 
357 aa  92.4  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00027327  normal  0.0103543 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2114  GTP-binding protein, HSR1-related  22.95 
 
 
330 aa  86.3  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0185  GTPase ObgE  41.82 
 
 
347 aa  82.8  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3378  GTP-binding protein Obg/CgtA  36.08 
 
 
454 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0194  TGS domain protein  23.04 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20124  predicted protein  41.28 
 
 
400 aa  81.3  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.52 
 
 
426 aa  81.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  25.07 
 
 
324 aa  81.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.26 
 
 
427 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.63 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  41.28 
 
 
516 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  32.59 
 
 
352 aa  80.5  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  39.66 
 
 
432 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  38.79 
 
 
437 aa  80.5  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0796  GTPase ObgE  28.89 
 
 
390 aa  80.1  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000620978  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  38.79 
 
 
430 aa  79.7  0.00000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  38.79 
 
 
435 aa  79.7  0.00000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  37.93 
 
 
430 aa  79.3  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  37.93 
 
 
430 aa  79.3  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl522  GTPase ObgE  36.75 
 
 
432 aa  79.3  0.0000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  40 
 
 
416 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.61 
 
 
517 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2143  GTPase ObgE  34.4 
 
 
529 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.37985e-16 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  35.14 
 
 
348 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1650  GTPase ObgE  37.96 
 
 
509 aa  78.2  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420929  hitchhiker  0.000176178 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  38.79 
 
 
427 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.52 
 
 
438 aa  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  38.79 
 
 
428 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  42.98 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0476  GTPase ObgE  29.53 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000104171  normal  0.949161 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  37.93 
 
 
437 aa  77.8  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2389  GTPase ObgE  34.4 
 
 
529 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045234  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3455  GTPase ObgE  37.5 
 
 
513 aa  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382796  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  35.14 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1726  GTPase ObgE  46.07 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  38.79 
 
 
428 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.33 
 
 
452 aa  77  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  39.67 
 
 
343 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  38.79 
 
 
428 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5258  GTPase ObgE  38.46 
 
 
541 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  38.79 
 
 
428 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  38.79 
 
 
428 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  38.79 
 
 
428 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  38.79 
 
 
428 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  38.79 
 
 
428 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0131  GTPase ObgE  39.67 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0561  GTPase ObgE  28.33 
 
 
390 aa  76.3  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00587502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  38.79 
 
 
428 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2180  GTPase ObgE  36.94 
 
 
454 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  38.1 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  38.79 
 
 
428 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  38.79 
 
 
428 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.83 
 
 
415 aa  76.3  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  36.52 
 
 
458 aa  76.3  0.0000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0091  GTPase ObgE  39.34 
 
 
350 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf270  GTPase ObgE  35.09 
 
 
422 aa  75.9  0.000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.320591  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  31.76 
 
 
435 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  31.76 
 
 
435 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  28.67 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2458  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.07 
 
 
450 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  42.15 
 
 
327 aa  75.9  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3357  GTPase ObgE  27.17 
 
 
392 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0207536  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.81 
 
 
463 aa  75.5  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10130  GTPase ObgE  36.36 
 
 
515 aa  75.1  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.398815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>