269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50650 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_50650  predicted protein  100 
 
 		 463 aa  950    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  63.02 
 
 		 407 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  62.41 
 
 		 418 aa  531  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  63.12 
 
 		 455 aa  529  1e-149  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  63.68 
 
 		 452 aa  525  1e-148  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  62.29 
 
 		 406 aa  528  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  59.73 
 
 		 457 aa  523  1e-147  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  62.53 
 
 		 406 aa  521  1e-147  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  62.1 
 
 		 468 aa  522  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119498  geranylgeranyl reductase  64.55 
 
 		 462 aa  521  1e-146  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  61.35 
 
 		 446 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  62.01 
 
 		 405 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  62.01 
 
 		 405 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  61.59 
 
 		 446 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  61.65 
 
 		 446 aa  518  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  61.03 
 
 		 405 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  60.39 
 
 		 449 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  61.41 
 
 		 445 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  60.44 
 
 		 443 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  60.44 
 
 		 443 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  38.93 
 
 		 421 aa  291  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  41.77 
 
 		 379 aa  289  9e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  40.69 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  41.28 
 
 		 380 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  40.83 
 
 		 380 aa  265  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  40.1 
 
 		 380 aa  261  1e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  40.24 
 
 		 380 aa  253  5.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  35.87 
 
 		 406 aa  251  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  35.38 
 
 		 406 aa  246  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  38.2 
 
 		 380 aa  242  7.999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  35.61 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  34.55 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  34.41 
 
 		 400 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  34.41 
 
 		 394 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  34.41 
 
 		 394 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  37.16 
 
 		 394 aa  199  9e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  32.99 
 
 		 401 aa  193  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  34.63 
 
 		 405 aa  190  5e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5367  geranylgeranyl reductase  31.84 
 
 		 397 aa  189  8e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.707854 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0167  geranylgeranyl reductase  33.99 
 
 		 393 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  34.16 
 
 		 394 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  29.97 
 
 		 408 aa  177  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6424  geranylgeranyl reductase  30.57 
 
 		 403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5289  geranylgeranyl reductase  31.76 
 
 		 397 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  31.78 
 
 		 402 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2063  geranylgeranyl reductase  31.58 
 
 		 399 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104109 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4822  geranylgeranyl reductase  31.32 
 
 		 397 aa  172  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.0333239 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2779  geranylgeranyl reductase  32.16 
 
 		 330 aa  161  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0629  geranylgeranyl reductase  30.87 
 
 		 413 aa  144  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978932  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  29.01 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  28.39 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  28.82 
 
 		 387 aa  99.4  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  27.45 
 
 		 390 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  28.65 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  29.09 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  29.04 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  27.4 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  27.3 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  24.21 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1604  geranylgeranyl reductase  26.14 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  26.17 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  25.38 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  27.97 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  26.3 
 
 		 389 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  26.67 
 
 		 425 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  27.86 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  26.55 
 
 		 403 aa  79  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  26.38 
 
 		 434 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  27.36 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  26.95 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  25.72 
 
 		 391 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  28.62 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  28.17 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  30.56 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  27.11 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  26.75 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  27.38 
 
 		 362 aa  73.2  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  28.7 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  24.5 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  24.2 
 
 		 396 aa  73.2  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  28.57 
 
 		 409 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  25.08 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  27.02 
 
 		 379 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  27.16 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  26.67 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  27.01 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  26.46 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  25.92 
 
 		 396 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  26.67 
 
 		 399 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  27.12 
 
 		 362 aa  69.7  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  25.5 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  23.69 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  26.83 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  24.46 
 
 		 457 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  24.82 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  23.29 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  23.71 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  27.88 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  28.31 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>