151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50629 on replicon NC_011701
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011701  PHATRDRAFT_50629  predicted protein  100 
 
 
304 aa  628  1e-179  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0067  translation initiation factor IF-3  32.17 
 
 
172 aa  64.7  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101132  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0082  translation initiation factor IF-3  29.37 
 
 
171 aa  61.2  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2858  translation initiation factor 3  36 
 
 
173 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  30.61 
 
 
156 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  30.61 
 
 
156 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  30.61 
 
 
156 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  30.61 
 
 
156 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  30.61 
 
 
156 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  30.61 
 
 
156 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  30.61 
 
 
156 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  30.61 
 
 
156 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  30.61 
 
 
156 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0994  translation initiation factor IF-3  30.61 
 
 
156 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  30.61 
 
 
156 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  30.61 
 
 
156 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3090  translation initiation factor IF-3  31.29 
 
 
179 aa  60.1  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  30.61 
 
 
156 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  30.61 
 
 
156 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  29.93 
 
 
156 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  36 
 
 
182 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  31.62 
 
 
170 aa  57.4  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1733  translation initiation factor IF-3  26.76 
 
 
212 aa  57.4  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.128322  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  29.93 
 
 
173 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2399  translation initiation factor 3  29.52 
 
 
205 aa  55.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1449  translation initiation factor IF-3  33.33 
 
 
178 aa  55.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0471  translation initiation factor IF-3  36 
 
 
171 aa  54.3  0.000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.973019  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1871  translation initiation factor IF-3  30.58 
 
 
181 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  27.89 
 
 
172 aa  53.5  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  34 
 
 
174 aa  53.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  31.47 
 
 
165 aa  53.5  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4615  translation initiation factor IF-3  29.25 
 
 
205 aa  53.1  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.550189  hitchhiker  0.00733617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  34 
 
 
194 aa  52.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2002  translation initiation factor 3  34.95 
 
 
153 aa  52.8  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112753  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  30.41 
 
 
169 aa  52.4  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  31.15 
 
 
186 aa  52  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1337  translation initiation factor IF-3  34 
 
 
171 aa  52.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  32 
 
 
177 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0412  translation initiation factor IF-3  35 
 
 
144 aa  52.4  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601649  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  28.57 
 
 
156 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  33.01 
 
 
155 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  28.08 
 
 
202 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  25.85 
 
 
219 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4551  translation initiation factor IF-3  26.03 
 
 
221 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2755  translation initiation factor IF-3  28.57 
 
 
156 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22658  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  31.13 
 
 
194 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  30.87 
 
 
173 aa  50.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  28.57 
 
 
156 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  31.13 
 
 
194 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  27.21 
 
 
178 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  27.21 
 
 
154 aa  50.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2385  translation initiation factor IF-3  28.86 
 
 
192 aa  49.7  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157849  normal  0.289584 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1887  translation initiation factor 3  29.93 
 
 
160 aa  49.7  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.729735  normal  0.011077 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  32 
 
 
173 aa  49.7  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  30 
 
 
190 aa  49.3  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1768  translation initiation factor IF-3  27.03 
 
 
221 aa  49.3  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.40976 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  29.23 
 
 
146 aa  49.3  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288109  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1924  translation initiation factor IF-3  29.93 
 
 
180 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000676935  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01676  hypothetical protein  29.93 
 
 
180 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0101258  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  30.34 
 
 
154 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1763  translation initiation factor 3  29.01 
 
 
137 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1914  translation initiation factor IF-3  29.93 
 
 
180 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119522  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  30.87 
 
 
233 aa  48.9  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0232  translation initiation factor 3  30.61 
 
 
211 aa  48.5  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.627991  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0007  translation initiation factor IF-3  25.53 
 
 
173 aa  47.8  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  hitchhiker  0.00109287  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0724  translation initiation factor IF-3  29.93 
 
 
194 aa  48.1  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000346718  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0190  translation initiation factor IF-3  30.61 
 
 
186 aa  48.1  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.140917  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1314  translation initiation factor IF-3  30.16 
 
 
185 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241721  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1889  translation initiation factor IF-3  31.29 
 
 
180 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  28.86 
 
 
173 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  30.47 
 
 
198 aa  47.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  26.92 
 
 
356 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000187235 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0329  translation initiation factor IF-3  29.25 
 
 
172 aa  47.4  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000359846  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  30.65 
 
 
396 aa  47  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  28.57 
 
 
145 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1818  translation initiation factor IF-3  29.37 
 
 
165 aa  47  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.228131  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  26.39 
 
 
193 aa  47  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  28.68 
 
 
207 aa  47  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0935  translation initiation factor IF-3  25.81 
 
 
159 aa  47  0.0005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00138169  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  27.97 
 
 
171 aa  46.6  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  26.85 
 
 
156 aa  46.6  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  26.53 
 
 
195 aa  46.6  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  25.87 
 
 
173 aa  46.2  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  27.52 
 
 
225 aa  46.6  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  30.7 
 
 
169 aa  46.2  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2181  translation initiation factor IF-3  30.61 
 
 
180 aa  46.2  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0268784  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1952  translation initiation factor IF-3  35 
 
 
180 aa  45.8  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.26259  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  35 
 
 
159 aa  46.2  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01687  translation initiation factor IF-3  29.45 
 
 
144 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00539573  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2052  translation initiation factor IF-3  30.61 
 
 
180 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0593383  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  28.26 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  27.81 
 
 
174 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1462  translation initiation factor IF-3  29.45 
 
 
144 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131964  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1839  translation initiation factor IF-3  29.45 
 
 
144 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057261  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2436  translation initiation factor IF-3  29.45 
 
 
144 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000110655  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1799  translation initiation factor IF-3  29.45 
 
 
144 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017178  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1936  translation initiation factor IF-3  29.45 
 
 
144 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150093  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1473  translation initiation factor IF-3  29.45 
 
 
144 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000416491  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1429  translation initiation factor IF-3  29.45 
 
 
144 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00177736  hitchhiker  0.00888747 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1960  translation initiation factor IF-3  29.45 
 
 
144 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>