36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50525 on replicon NC_011699
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011699  PHATRDRAFT_50525  predicted protein  100 
 
 
688 aa  1420    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3675  NmrA-like  26.52 
 
 
315 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.12291  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  28.53 
 
 
316 aa  95.9  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04620  hypothetical protein  25.29 
 
 
309 aa  88.6  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599307  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04608  NmrA family transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06920)  30.4 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113865  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  27.89 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0766  NmrA family protein  28.04 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0676287  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04630  conserved hypothetical protein  23.81 
 
 
311 aa  72.8  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.361856  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0821  hypothetical protein  26.85 
 
 
326 aa  72.8  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107577  unclonable  0.0000119354 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0874  NmrA family protein  29.27 
 
 
317 aa  70.5  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09332  conserved hypothetical protein  34.38 
 
 
324 aa  65.1  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0602529  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  26.69 
 
 
300 aa  64.7  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  26.74 
 
 
298 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09354  conserved hypothetical protein  34.96 
 
 
311 aa  62  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.471482  hitchhiker  0.00666218 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01600  conserved hypothetical protein  26.09 
 
 
318 aa  58.5  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561734  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2282  NmrA family protein  24.57 
 
 
319 aa  57.8  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1053  NmrA-like protein  25.53 
 
 
315 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1069  NmrA family protein  25.53 
 
 
315 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  24.88 
 
 
307 aa  54.3  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  24.38 
 
 
315 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  30.65 
 
 
301 aa  53.9  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1080  NmrA family protein  25.53 
 
 
315 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.803259  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0390  NADPH-dependent reductase  22.89 
 
 
345 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0157595  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  33.59 
 
 
297 aa  52.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  22.42 
 
 
273 aa  51.6  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  22.42 
 
 
273 aa  51.6  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10751  hypothetical protein  23.32 
 
 
345 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0490933  normal  0.0263054 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  24.04 
 
 
305 aa  48.5  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09531  conserved hypothetical protein  30 
 
 
334 aa  48.1  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  23.19 
 
 
292 aa  47.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  30.33 
 
 
298 aa  45.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  31.45 
 
 
291 aa  45.4  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3410  NmrA family protein  26.29 
 
 
295 aa  44.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11403  normal  0.0133757 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  27.73 
 
 
305 aa  44.3  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  31.43 
 
 
300 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  43.59 
 
 
275 aa  44.3  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>