More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50516 on replicon NC_011698
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011698  PHATRDRAFT_50516  predicted protein  100 
 
 
806 aa  1651    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44149  predicted protein  58.24 
 
 
459 aa  512  1e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104122  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44889  predicted protein  37.48 
 
 
892 aa  347  6e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.423509  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  26.76 
 
 
399 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  28.18 
 
 
404 aa  119  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  26.57 
 
 
396 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  28.72 
 
 
399 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  26.98 
 
 
460 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  27.72 
 
 
385 aa  103  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  26.76 
 
 
399 aa  103  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  27.79 
 
 
386 aa  103  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  28.12 
 
 
375 aa  102  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  28.4 
 
 
400 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  28.67 
 
 
397 aa  102  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  26.04 
 
 
387 aa  100  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  26.54 
 
 
423 aa  100  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  27.04 
 
 
375 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  30.31 
 
 
404 aa  99.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  27.3 
 
 
375 aa  99.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  27.04 
 
 
375 aa  99  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  27.04 
 
 
375 aa  99  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  27.04 
 
 
375 aa  99  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  27.04 
 
 
375 aa  99  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  27.74 
 
 
485 aa  98.6  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  25.91 
 
 
387 aa  98.2  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  25 
 
 
385 aa  98.6  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  26.79 
 
 
375 aa  97.8  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08100  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  27.48 
 
 
583 aa  97.4  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0169724 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  25.8 
 
 
387 aa  97.8  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  25.8 
 
 
387 aa  97.8  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  25.55 
 
 
387 aa  97.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  25.55 
 
 
387 aa  96.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  25.36 
 
 
412 aa  97.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  24.94 
 
 
387 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  25.55 
 
 
387 aa  97.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 
446 aa  96.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  27.25 
 
 
375 aa  95.9  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  26.28 
 
 
650 aa  96.3  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.88 
 
 
427 aa  95.9  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  26.36 
 
 
424 aa  95.5  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  25.56 
 
 
424 aa  95.1  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  27.46 
 
 
395 aa  94.4  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  24.56 
 
 
379 aa  94.4  7e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  25.31 
 
 
387 aa  94.4  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  25.31 
 
 
387 aa  94.4  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  25.94 
 
 
474 aa  93.6  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0995  sodium/hydrogen exchanger  25.99 
 
 
452 aa  93.2  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  26.81 
 
 
491 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  26.72 
 
 
389 aa  92  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  24.82 
 
 
445 aa  91.3  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  26.36 
 
 
473 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  29.59 
 
 
453 aa  90.5  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  27.8 
 
 
469 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  24.5 
 
 
764 aa  89  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1412  sodium/hydrogen exchanger  25.98 
 
 
395 aa  86.7  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.179509 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  24.17 
 
 
775 aa  87  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  26.79 
 
 
375 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  26.8 
 
 
773 aa  86.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  26.79 
 
 
375 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  25.84 
 
 
382 aa  86.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  26.79 
 
 
375 aa  85.9  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.72 
 
 
418 aa  85.1  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  25.34 
 
 
352 aa  85.1  0.000000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  23.57 
 
 
715 aa  84.3  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  24.95 
 
 
567 aa  84  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  26.76 
 
 
479 aa  83.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  26.46 
 
 
402 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  23.26 
 
 
756 aa  83.6  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  24.3 
 
 
389 aa  83.2  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2667  sodium/hydrogen exchanger  26.62 
 
 
767 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  26.63 
 
 
479 aa  82.4  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2359  Na+/H+ antiporter  29.64 
 
 
460 aa  82.4  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  26.22 
 
 
567 aa  82  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  26.17 
 
 
657 aa  82  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  23.96 
 
 
749 aa  81.6  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  24.94 
 
 
416 aa  81.3  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  25.77 
 
 
664 aa  81.3  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  23.08 
 
 
750 aa  80.9  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  25.44 
 
 
682 aa  80.5  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  24.87 
 
 
398 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  26.24 
 
 
771 aa  80.5  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  23.03 
 
 
748 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.74 
 
 
567 aa  79  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  27.3 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4171  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  24.67 
 
 
613 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  21.99 
 
 
767 aa  78.6  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  25.26 
 
 
665 aa  78.2  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48700  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  24.89 
 
 
613 aa  77.8  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00097615 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0454  Na+/H+ antiporter  23.16 
 
 
701 aa  77.8  0.0000000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.809076  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  25.19 
 
 
676 aa  77.8  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  26.29 
 
 
665 aa  77.4  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  23.82 
 
 
747 aa  75.9  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  26.19 
 
 
387 aa  75.9  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  27.18 
 
 
414 aa  75.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  24.15 
 
 
482 aa  75.5  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  24.23 
 
 
617 aa  75.1  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  25.18 
 
 
436 aa  75.1  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20501  CPA2 family Na+/H+ antiporter  26.04 
 
 
457 aa  74.7  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0786073  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1175  Na+/H+ antiporter  26.04 
 
 
457 aa  74.7  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  25.57 
 
 
775 aa  74.7  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>