67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50511 on replicon NC_011698
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011698  PHATRDRAFT_50511  predicted protein  100 
 
 		 487 aa  1020    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48934  predicted protein  34.78 
 
 		 427 aa  243  7.999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39534  predicted protein  33.1 
 
 		 572 aa  236  8e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36581  predicted protein  30 
 
 		 270 aa  76.3  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  22.58 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3389  hypothetical protein  24.86 
 
 		 299 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0021  protein of unknown function UPF0187  25.84 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  34.52 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  34.09 
 
 		 299 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  35.8 
 
 		 299 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0016  protein of unknown function UPF0187  25.84 
 
 		 315 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5346  hypothetical protein  29.09 
 
 		 303 aa  56.6  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00567307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  35.8 
 
 		 299 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  26.45 
 
 		 310 aa  55.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  35.8 
 
 		 299 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3207  hypothetical protein  23.7 
 
 		 310 aa  55.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  29.13 
 
 		 306 aa  54.3  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1301  hypothetical protein  26.02 
 
 		 300 aa  53.5  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0943303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43405  predicted protein  30.23 
 
 		 613 aa  53.5  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.297103  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2252  hypothetical protein  32.93 
 
 		 299 aa  53.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.629804 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  27.41 
 
 		 305 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3495  hypothetical protein  23.66 
 
 		 310 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4406  protein of unknown function UPF0187  23.85 
 
 		 325 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5376  hypothetical protein  36.36 
 
 		 315 aa  50.1  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2950  hypothetical protein  29.9 
 
 		 307 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.345922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3226  hypothetical protein  33.77 
 
 		 314 aa  50.1  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4544  hypothetical protein  31.15 
 
 		 321 aa  50.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0214885  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3414  hypothetical protein  32.18 
 
 		 306 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  33.77 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45771  predicted protein  23.58 
 
 		 947 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  33.77 
 
 		 304 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  33.77 
 
 		 304 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  33.77 
 
 		 304 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  33.77 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  25 
 
 		 306 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  33.77 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4016  hypothetical protein  32.97 
 
 		 296 aa  48.9  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  33.77 
 
 		 321 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  33.77 
 
 		 321 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2127  hypothetical protein  27.55 
 
 		 298 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  32.47 
 
 		 308 aa  48.5  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0608  protein of unknown function UPF0187  20.06 
 
 		 321 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  24.28 
 
 		 303 aa  48.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3475  hypothetical protein  30.61 
 
 		 308 aa  48.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1022  protein of unknown function UPF0187  28.57 
 
 		 308 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.88279 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3128  hypothetical protein  29.91 
 
 		 305 aa  47.4  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0834  hypothetical protein  30.77 
 
 		 304 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.725312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2014  hypothetical protein  32.47 
 
 		 304 aa  47.4  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00931147  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3057  hypothetical protein  31.58 
 
 		 277 aa  47  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1404  protein of unknown function UPF0187  29.49 
 
 		 306 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453282  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1456  protein of unknown function UPF0187  30.99 
 
 		 309 aa  47  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2042  protein of unknown function UPF0187  35.06 
 
 		 286 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0364314  hitchhiker  0.00398813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0277  protein of unknown function UPF0187  24.62 
 
 		 302 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04190  conserved hypothetical protein  21.31 
 
 		 538 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1229  hypothetical protein  32.47 
 
 		 308 aa  46.6  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  32.47 
 
 		 321 aa  46.6  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0922  hypothetical protein  20.17 
 
 		 307 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2717  protein of unknown function UPF0187  23.23 
 
 		 303 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0718878  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0993  hypothetical protein  32.97 
 
 		 290 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000360463  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5036  protein of unknown function UPF0187  29.7 
 
 		 305 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  20.3 
 
 		 302 aa  44.3  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  25.24 
 
 		 307 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2042  hypothetical protein  27.03 
 
 		 303 aa  44.3  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3933  hypothetical protein  32.53 
 
 		 309 aa  44.3  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2942  hypothetical protein  34.29 
 
 		 287 aa  43.9  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0047162  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5683  hypothetical protein  24.85 
 
 		 306 aa  43.5  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.326794 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6441  hypothetical protein  24.85 
 
 		 306 aa  43.5  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549137 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>