85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50476 on replicon NC_011698
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011698  PHATRDRAFT_50476  predicted protein  100 
 
 
383 aa  783    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000145528  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00658  glutathione peroxidase  31.69 
 
 
161 aa  59.7  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0965068  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  34.13 
 
 
162 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78456  glutathione peroxidase  28.92 
 
 
160 aa  56.6  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.437317  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2660  Glutathione peroxidase  32.73 
 
 
159 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0609505 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  30.71 
 
 
161 aa  55.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  41.18 
 
 
160 aa  55.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  30.16 
 
 
165 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  40 
 
 
168 aa  54.3  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  29.92 
 
 
161 aa  53.5  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30390  glutathione peroxidase  33.05 
 
 
173 aa  53.1  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  30.12 
 
 
164 aa  53.1  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  29.37 
 
 
165 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2934  glutathione peroxidase  36.62 
 
 
164 aa  52.8  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0465616  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  30.67 
 
 
159 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06070  glutathione peroxidase  27.39 
 
 
162 aa  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  33.06 
 
 
158 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  35.37 
 
 
165 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0956  glutathione peroxidase  41.43 
 
 
168 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1075  glutathione peroxidase  41.43 
 
 
168 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.364498  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  35.37 
 
 
165 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  28.57 
 
 
163 aa  50.4  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2931  glutathione peroxidase  31.48 
 
 
159 aa  50.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.953337 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  30.34 
 
 
159 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  29.61 
 
 
159 aa  49.7  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1771  glutathione peroxidase  33.77 
 
 
161 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  36.23 
 
 
165 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2176  glutathione peroxidase  38.81 
 
 
143 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0884553  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  29.61 
 
 
159 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2699  glutathione peroxidase  44.78 
 
 
160 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  29.92 
 
 
161 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  40.91 
 
 
159 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3298  glutathione peroxidase  26.28 
 
 
161 aa  47.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40101  decreased coverage  0.0000000224321 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  28.38 
 
 
160 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  28.95 
 
 
159 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  39.39 
 
 
162 aa  47  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52875  Hydroperoxide resistance conferring gene. Sensor and transducer of the hydroperoxide signal to Yap1. Hydroperoxide receptor and redox-transducer  27.21 
 
 
185 aa  47.4  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.187379  normal  0.741014 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  28.38 
 
 
160 aa  47  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0007  glutathione peroxidase  29.03 
 
 
157 aa  47.4  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2454  Peroxiredoxin  32.26 
 
 
160 aa  47.4  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0184161  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2798  glutathione peroxidase  37.31 
 
 
164 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  28.95 
 
 
159 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  28.95 
 
 
159 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  28.95 
 
 
159 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  29.05 
 
 
160 aa  47  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  37.88 
 
 
161 aa  47  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  29.05 
 
 
160 aa  47  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02846  phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase (Eurofung)  27.6 
 
 
282 aa  46.6  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.440988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  28.29 
 
 
159 aa  46.6  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  28.95 
 
 
159 aa  46.6  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  28.95 
 
 
159 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  28.95 
 
 
159 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  28.95 
 
 
159 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  28.95 
 
 
159 aa  46.6  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  28.95 
 
 
159 aa  46.6  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  28.95 
 
 
159 aa  46.6  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  28 
 
 
161 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1318  Peroxiredoxin  31.01 
 
 
167 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0324  Glutathione peroxidase  26.81 
 
 
165 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.324106  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3198  Glutathione peroxidase protein  37.1 
 
 
159 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  28.38 
 
 
160 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  37.5 
 
 
161 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  37.88 
 
 
160 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1769  glutathione peroxidase  30.36 
 
 
162 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0182367  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  38.55 
 
 
161 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  28.24 
 
 
160 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  37.68 
 
 
161 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2741  glutathione peroxidase  30.49 
 
 
162 aa  44.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000260986  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  28.8 
 
 
158 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  31.76 
 
 
161 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  27.7 
 
 
160 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2639  glutathione peroxidase  33.01 
 
 
158 aa  44.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.833403 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15450  Glutathione peroxidase  32.54 
 
 
158 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0674744  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  27.7 
 
 
160 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48636  glutathione peroxidase domain-containing protein  26.06 
 
 
177 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  36.9 
 
 
165 aa  44.3  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  33.78 
 
 
161 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1872  glutathione peroxidase  30.47 
 
 
159 aa  43.5  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0683727  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  27.03 
 
 
160 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  27.03 
 
 
160 aa  43.1  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  31.03 
 
 
161 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0446  Glutathione peroxidase  30.84 
 
 
157 aa  42.7  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000054357  normal  0.0344695 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2006  glutathione peroxidase family protein  33.82 
 
 
160 aa  43.1  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  28.8 
 
 
158 aa  42.7  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  25.69 
 
 
162 aa  42.7  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>