21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50474 on replicon NC_011698
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011698  PHATRDRAFT_50474  predicted protein  100 
 
 
747 aa  1546    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0241823  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47613  predicted protein  26.52 
 
 
601 aa  75.5  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_93465  predicted protein  34.62 
 
 
278 aa  59.3  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00870525 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3246  hypothetical protein  26.53 
 
 
444 aa  50.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0143918  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  33.73 
 
 
344 aa  49.3  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4286  hypothetical protein  25.47 
 
 
406 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  36.78 
 
 
285 aa  48.9  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0216  hypothetical protein  27.14 
 
 
411 aa  47.8  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.380044  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.77 
 
 
297 aa  47.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49556  predicted protein  27.78 
 
 
541 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1208  hypothetical protein  27.21 
 
 
273 aa  46.2  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44877  predicted protein  30.65 
 
 
476 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2170  SAM dependent methyltransferase  25 
 
 
389 aa  46.6  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000185773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5884  hypothetical protein  29.86 
 
 
376 aa  46.2  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  31.94 
 
 
297 aa  45.4  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3988  hypothetical protein  24.53 
 
 
406 aa  45.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1301  hypothetical protein  24.68 
 
 
410 aa  45.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1388  hypothetical protein  25.69 
 
 
316 aa  44.7  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.580815  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0449  hypothetical protein  33.9 
 
 
392 aa  44.3  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114768  decreased coverage  0.00000434601 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  32.95 
 
 
285 aa  44.3  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  32.95 
 
 
285 aa  44.3  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>