20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50414 on replicon NC_011697
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011697  PHATRDRAFT_50414  predicted protein  100 
 
 		 262 aa  529  1e-149  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0185184  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41374  predicted protein  100 
 
 		 262 aa  529  1e-149  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00887084  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1579  hypothetical protein  35.94 
 
 		 464 aa  76.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00110  conserved hypothetical protein  35.92 
 
 		 1608 aa  72  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108047  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34148  predicted protein  31.79 
 
 		 466 aa  69.7  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0271154  normal  0.859268 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34199  predicted protein  33.33 
 
 		 471 aa  69.3  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48225  predicted protein  26.22 
 
 		 368 aa  52.4  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0906854  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1356  GALA protein 4  29.35 
 
 		 620 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01686  GALA protein 1  35.11 
 
 		 661 aa  48.9  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5718  predicted protein  37.89 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0287737  decreased coverage  0.00877055 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1477  hypothetical protein  29.44 
 
 		 614 aa  47  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01777  GALA protein  36.63 
 
 		 981 aa  47  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40174  predicted protein  41.18 
 
 		 897 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42557  predicted protein  29.53 
 
 		 692 aa  46.2  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1801  GALA protein 3  30.19 
 
 		 522 aa  46.2  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578004  normal  0.0997916 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39238  predicted protein  24.79 
 
 		 591 aa  45.4  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.975604  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2293  predicted protein  29.08 
 
 		 432 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.531902 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1120  hypothetical protein  28.26 
 
 		 781 aa  43.1  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1800  GALA protein  35.92 
 
 		 401 aa  42.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0919922 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47725  predicted protein  25 
 
 		 1097 aa  42  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>