26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50411 on replicon NC_011697
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011697  PHATRDRAFT_50411  predicted protein  100 
 
 
423 aa  859    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.918794  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29618  predicted protein  24.63 
 
 
744 aa  89  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42688  predicted protein  33.33 
 
 
700 aa  84  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31572  predicted protein  26.88 
 
 
536 aa  72.4  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.314666  normal  0.270485 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2458  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  26.92 
 
 
377 aa  67.4  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0995914 
 
 
-
 
NC_003296  RS04706  putative PPR repeats containing protein  36.36 
 
 
1373 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.380322 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29142  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  24.88 
 
 
632 aa  60.5  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00572015  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36970  predicted protein  26.64 
 
 
414 aa  59.7  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50002  predicted protein  28.99 
 
 
1122 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.736142  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33231  predicted protein  23.21 
 
 
918 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_89032  predicted protein  23.81 
 
 
683 aa  50.8  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.356102  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19174  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  23.81 
 
 
629 aa  50.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29163  predicted protein  30.63 
 
 
505 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0206016  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14352  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  24.45 
 
 
444 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.373458  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49642  predicted protein  27.92 
 
 
705 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54064  predicted protein  27.78 
 
 
447 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530235  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24879  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  32.12 
 
 
424 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30981  predicted protein  21.68 
 
 
439 aa  46.6  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116585  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43695  predicted protein  24.12 
 
 
1060 aa  46.6  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.044454  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49258  predicted protein  28.12 
 
 
1167 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01190  conserved hypothetical protein  31.19 
 
 
1464 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92797  predicted protein  30.94 
 
 
837 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.189677  normal  0.345791 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34060  predicted protein  26.32 
 
 
576 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47331  predicted protein  24.84 
 
 
879 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.217105  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47265  predicted protein  24.84 
 
 
709 aa  43.5  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.285264  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47986  predicted protein  25.64 
 
 
712 aa  43.1  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>