31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50353 on replicon NC_011697
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011697  PHATRDRAFT_50353  predicted protein  100 
 
 
553 aa  1130    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1713  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.44 
 
 
475 aa  440  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000796531  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0981  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.23 
 
 
472 aa  426  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2635  putative 2-nitropropane dioxygenase  48.03 
 
 
491 aa  425  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4298  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.28 
 
 
481 aa  421  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15389  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0849  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.95 
 
 
505 aa  395  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.183629  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5685  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.59 
 
 
476 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3653  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.66 
 
 
472 aa  383  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.042009  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1622  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.41 
 
 
487 aa  385  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1611  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.76 
 
 
485 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0274193 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1446  putative 2-nitropropane dioxygenase  43.95 
 
 
486 aa  354  2.9999999999999997e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00192568  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0188  hypothetical protein  25.17 
 
 
417 aa  55.1  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0706904  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1025  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.78 
 
 
366 aa  53.9  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1586  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  26.16 
 
 
373 aa  53.5  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.385159  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0670  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.33 
 
 
421 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0766  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.08 
 
 
373 aa  53.5  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0843777 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1158  2-nitropropane dioxygenase NPD  25 
 
 
357 aa  50.4  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0552766 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.01 
 
 
419 aa  50.4  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0779  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.87 
 
 
418 aa  50.4  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0610  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.57 
 
 
417 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2272  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.09 
 
 
424 aa  49.3  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.189277  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0649  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.01 
 
 
365 aa  48.1  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1164  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.87 
 
 
373 aa  47.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121776  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2873  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24 
 
 
415 aa  46.6  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0406  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.9 
 
 
357 aa  46.6  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.25833  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1851  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.71 
 
 
373 aa  44.7  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000135103  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1055  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.82 
 
 
361 aa  44.7  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.455716  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0091  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.61 
 
 
382 aa  43.9  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2985  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.74 
 
 
364 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1249  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  28.66 
 
 
355 aa  43.5  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1939  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.35 
 
 
419 aa  43.5  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>