32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50239 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011696  PHATRDRAFT_50239  predicted protein  100 
 
 
377 aa  782    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2462  glutamine cyclotransferase  42.49 
 
 
262 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704025  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0278  glutamine cyclotransferase  40.49 
 
 
364 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.286822  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3371  glutamine cyclotransferase  41.56 
 
 
279 aa  177  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10783  Glutamine cyclotransferase  40.43 
 
 
348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.459994  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0828  glutamine cyclotransferase  40.77 
 
 
272 aa  167  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.168096  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2500  glutamine cyclotransferase  41.3 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44182  predicted protein  39.06 
 
 
613 aa  162  7e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3145  glutamine cyclotransferase  40.69 
 
 
276 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1498  glutamine cyclotransferase  40.69 
 
 
256 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4569  glutamine cyclotransferase  39.13 
 
 
349 aa  160  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20936  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0484  glutamine cyclotransferase  41.13 
 
 
259 aa  159  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4041  glutamine cyclotransferase  39.57 
 
 
263 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.66417  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0172  glutamine cyclotransferase  39.57 
 
 
263 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0504  hypothetical protein  39.57 
 
 
263 aa  157  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000894372  hitchhiker  0.00102967 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00869  glutamine cyclotransferase  38.63 
 
 
272 aa  153  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.268482  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2647  glutamine cyclotransferase  41.49 
 
 
330 aa  152  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1300  glutamine cyclotransferase  38.79 
 
 
274 aa  150  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1974  glutamine cyclotransferase  35.81 
 
 
349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.424232  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2930  glutamine cyclotransferase  36.8 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238347  normal  0.0784763 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1065  glutamine cyclotransferase  40.61 
 
 
257 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2900  glutamine cyclotransferase  35.5 
 
 
264 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2944  glutamine cyclotransferase  35.5 
 
 
264 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1722  glutamine cyclotransferase  36.8 
 
 
256 aa  143  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.767878  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1326  glutamine cyclotransferase  39.82 
 
 
263 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.211339  normal  0.38005 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6727  glutamine cyclotransferase  36.32 
 
 
362 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.740303 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0451  glutamine cyclotransferase  37.93 
 
 
255 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0267078  normal  0.572898 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5761  glutamine cyclotransferase  39.29 
 
 
256 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651686  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34010  glutamine cyclotransferase  35.5 
 
 
277 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.334448  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1980  glutamine cyclotransferase  35.44 
 
 
289 aa  113  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1469  glutamine cyclotransferase-like  32.17 
 
 
284 aa  110  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_6083  predicted protein  33.05 
 
 
251 aa  106  7e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0734662  normal  0.474336 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>