More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50228 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011696  PHATRDRAFT_50228  predicted protein  100 
 
 
904 aa  1876    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  48.92 
 
 
782 aa  152  4e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  27.19 
 
 
1831 aa  130  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00940  transcription initiation factor tfiid 90 kda subunit (tafii-90), putative  47.66 
 
 
813 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.152566  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50593  predicted protein  48.41 
 
 
617 aa  129  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.594901  normal  0.592668 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00292  transcription initiation factor TFIID subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03070)  43.48 
 
 
606 aa  122  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00299159  normal  0.644069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  29.17 
 
 
1652 aa  121  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  32.58 
 
 
696 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  28.99 
 
 
1363 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  28.87 
 
 
1552 aa  108  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  29.81 
 
 
947 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  30.1 
 
 
1163 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  27.76 
 
 
1789 aa  106  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  31.46 
 
 
919 aa  104  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  27.18 
 
 
1229 aa  103  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.39 
 
 
1598 aa  103  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  26.52 
 
 
1190 aa  101  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  29.51 
 
 
1221 aa  101  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.04 
 
 
1262 aa  100  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.77 
 
 
1240 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.7 
 
 
930 aa  99.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  29.23 
 
 
1236 aa  99  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.21 
 
 
1557 aa  97.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  27.44 
 
 
1196 aa  97.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  25.99 
 
 
1188 aa  97.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.29 
 
 
1617 aa  96.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  29.79 
 
 
1242 aa  95.1  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.23 
 
 
1267 aa  95.1  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.5 
 
 
1686 aa  94.7  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  32.44 
 
 
1357 aa  94.7  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.96 
 
 
676 aa  94.7  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.66 
 
 
1599 aa  94.4  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  30.15 
 
 
1211 aa  94.4  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.55 
 
 
1583 aa  94  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.27 
 
 
737 aa  94.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  31.44 
 
 
675 aa  94  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.42 
 
 
1607 aa  93.6  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
1711 aa  93.2  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.5 
 
 
924 aa  93.6  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.92 
 
 
1623 aa  92.4  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  30 
 
 
1188 aa  92.8  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  28.01 
 
 
1304 aa  91.7  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  28.67 
 
 
1367 aa  91.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  26.67 
 
 
1193 aa  91.3  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  29.7 
 
 
1217 aa  91.3  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  27.44 
 
 
1416 aa  91.3  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  28.9 
 
 
1901 aa  90.9  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  26.62 
 
 
1161 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.03 
 
 
1626 aa  90.5  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  26.15 
 
 
1523 aa  90.5  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  26.62 
 
 
1161 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  27.86 
 
 
742 aa  90.5  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  23.85 
 
 
1164 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.35 
 
 
1609 aa  89.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  26.77 
 
 
1474 aa  90.1  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  27.68 
 
 
1491 aa  90.1  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12028  predicted protein  27.84 
 
 
618 aa  89  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400153  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  27.38 
 
 
1807 aa  88.6  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  27.86 
 
 
1344 aa  88.6  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26408  predicted protein  26.22 
 
 
516 aa  88.6  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0183976  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.52 
 
 
1481 aa  88.2  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.47 
 
 
716 aa  87.8  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  28.07 
 
 
1553 aa  87  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  27.9 
 
 
1100 aa  87.4  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.11 
 
 
642 aa  87  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  25.89 
 
 
1348 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.45 
 
 
682 aa  86.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.04 
 
 
1684 aa  86.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  26.57 
 
 
1364 aa  85.9  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  26.21 
 
 
564 aa  85.9  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  29.3 
 
 
790 aa  85.1  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  27.86 
 
 
1510 aa  85.1  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  25.86 
 
 
1714 aa  85.1  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.17 
 
 
1760 aa  85.1  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  26.15 
 
 
443 aa  84.7  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.86 
 
 
618 aa  84.3  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.34 
 
 
740 aa  84.3  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.65 
 
 
596 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  24.04 
 
 
1247 aa  82.8  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.56 
 
 
1868 aa  82.4  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  26.42 
 
 
1213 aa  82  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  26.67 
 
 
1176 aa  82  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  27.61 
 
 
1656 aa  81.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  27.12 
 
 
1209 aa  81.6  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.35 
 
 
1398 aa  81.6  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.39 
 
 
733 aa  81.6  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  26.06 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  24.35 
 
 
1858 aa  81.6  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  25.8 
 
 
344 aa  80.5  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  24.15 
 
 
464 aa  80.9  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  25.26 
 
 
1190 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.85 
 
 
677 aa  80.5  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.05 
 
 
630 aa  80.5  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  26.41 
 
 
1454 aa  80.1  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  33.33 
 
 
1330 aa  79.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  26.64 
 
 
1209 aa  78.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  24.53 
 
 
505 aa  79  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  24.76 
 
 
1477 aa  79  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.52 
 
 
1004 aa  79  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.28 
 
 
692 aa  78.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>