26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50189 on replicon NC_011695
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011695  PHATRDRAFT_50189  nucleotide transporter 3  100 
 
 		 666 aa  1384    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.384013  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46794  nucleotide transporter 4  36.26 
 
 		 591 aa  161  4e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0520076  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45145  nucleotide transporter 2  24.95 
 
 		 575 aa  78.6  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0739731  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0029  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 448 aa  77  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0641866  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0335  ADP, ATP carrier protein  26.49 
 
 		 529 aa  72  0.00000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00666368  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0448  hypothetical protein  22.25 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4166  hypothetical protein  22.65 
 
 		 458 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3857  hypothetical protein  24.03 
 
 		 458 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862287 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26360  Major facilitator family protein  20.69 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4316  hypothetical protein  22.72 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1896  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1530  major facilitator transporter  23.7 
 
 		 438 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749699  normal  0.343883 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09318  hypothetical protein  24.24 
 
 		 939 aa  61.2  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1229  hypothetical protein  24.04 
 
 		 450 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2661  major facilitator transporter  23.75 
 
 		 439 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1799  major facilitator transporter  23.57 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2784  transporter, putative  24.28 
 
 		 436 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49533  nucleotide transporter 1  22.34 
 
 		 610 aa  54.7  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3250  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 427 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.840395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0377  ATP/ADP translocase-like protein  22.22 
 
 		 430 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1369  hypothetical protein  22.73 
 
 		 442 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2643  major facilitator transporter  22.86 
 
 		 427 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268366  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4783  putative MFS superfamily transport protein  23.11 
 
 		 453 aa  52  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127813  normal  0.486857 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2512  major facilitator transporter  23.73 
 
 		 427 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3067  hypothetical protein  22.15 
 
 		 441 aa  47  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179764 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4002  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 463 aa  46.2  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>