164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50097 on replicon NC_011695
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011695  PHATRDRAFT_50097  predicted protein  100 
 
 
361 aa  750    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669765  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04270  threonine aldolase  34.11 
 
 
381 aa  105  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1074  L-threonine aldolase  31.88 
 
 
356 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0718237 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2895  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  30.42 
 
 
413 aa  96.3  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285403  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19940  threonine aldolase  26.12 
 
 
343 aa  95.9  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  26.64 
 
 
343 aa  94  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  26.64 
 
 
343 aa  94  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2254  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  28.32 
 
 
366 aa  91.7  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0700219 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  29.82 
 
 
341 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  27.8 
 
 
345 aa  89.7  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  26.76 
 
 
359 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1602  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  30.5 
 
 
371 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.932137  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3880  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  30.26 
 
 
380 aa  84  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417521  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0618  L-allo-threonine aldolase, putative  25.94 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.164351  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2292  threonine aldolase  23.08 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.899538  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0228  Threonine aldolase  27.93 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2826  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  29.67 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  26.52 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4651  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  26.85 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.542554 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  28.3 
 
 
343 aa  79.3  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  26.67 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2620  L-threonine aldolase  28.45 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2705  L-threonine aldolase  29 
 
 
351 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  27.05 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1588  L-threonine aldolase  29 
 
 
339 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5968  Threonine aldolase  26.99 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.904259  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5114  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  26.39 
 
 
347 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1281  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  26.51 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0380  Threonine aldolase  28.27 
 
 
338 aa  77  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0178  L-threonine aldolase  26.63 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3482  threonine aldolase  28.91 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  25.78 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00875  L-allo-threonine aldolase, PLP-dependent  26.2 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00881  hypothetical protein  26.2 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.554159  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  26.2 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  25.76 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4745  Threonine aldolase  26.96 
 
 
339 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2204  L-threonine aldolase  25.89 
 
 
335 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  25.76 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2609  Threonine aldolase  28 
 
 
366 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270764  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2726  L-threonine aldolase  26.2 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0974  L-threonine aldolase  26.2 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0943  L-threonine aldolase  26.2 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.59  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3310  threonine aldolase  27.1 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124779  normal  0.12149 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  25.76 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2772  Threonine aldolase  26.2 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.826971  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  25.76 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2461  L-threonine aldolase  26.2 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.994155  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33121  predicted protein  25.21 
 
 
368 aa  74.7  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.752316  normal  0.13405 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  26.2 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859325 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  25.76 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  27.31 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04680  threonine aldolase, putative  27.47 
 
 
458 aa  74.3  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  27.62 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0162  threonine aldolase  24.55 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.687717  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  26.87 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3290  Threonine aldolase  21.88 
 
 
344 aa  73.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170768 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5192  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  25.47 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5734  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  27.65 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.578423 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0162  L-threonine aldolase  26.09 
 
 
367 aa  73.6  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4794  threonine aldolase  27.14 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331333  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5386  threonine aldolase  27.14 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5475  threonine aldolase  27.14 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1386  L-threonine aldolase  26.52 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3255  threonine aldolase  28.97 
 
 
348 aa  72.8  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4817  threonine aldolase  27.1 
 
 
337 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49372  predicted protein  25 
 
 
400 aa  72.8  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71203  threonine aldolase  26.26 
 
 
373 aa  72  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200501  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5364  threonine aldolase  27.1 
 
 
337 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  24.54 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  22.81 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1834  L-allo-threonine aldolase  26.58 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2053  Threonine aldolase  27.31 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0834  L-allo-threonine aldolase  26.58 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0108221  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6238  Threonine aldolase  24.07 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  25.69 
 
 
461 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2851  L-threonine aldolase  25.78 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185965  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0430  low-specificity L-threonine aldolase  26.58 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0337  low-specificity L-threonine aldolase  26.58 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400783  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1781  Threonine aldolase  25.12 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1771  L-allo-threonine aldolase  26.58 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.444188  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1125  L-allo-threonine aldolase  26.58 
 
 
397 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.628839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2098  L-allo-threonine aldolase  26.58 
 
 
458 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0582  L-allo-threonine aldolase  25.12 
 
 
366 aa  70.1  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.519824  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3317  Threonine aldolase  25.12 
 
 
338 aa  69.7  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3700  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  24.64 
 
 
355 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  23.35 
 
 
344 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2069  L-threonine aldolase  27.09 
 
 
379 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1764  threonine aldolase  28.71 
 
 
388 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382651  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3793  threonine aldolase  25.12 
 
 
334 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08076  L-allo-threonine aldolase  24.07 
 
 
340 aa  68.9  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00986668  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5037  Threonine aldolase  24.14 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.258099 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  26.64 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  26.61 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0734  threonine aldolase  27.19 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3186  Threonine aldolase  24.5 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.685174  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3094  L-threonine aldolase  25.81 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000046  low-specificity L-threonine aldolase  23.75 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2111  L-allo-threonine aldolase  23.66 
 
 
352 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486975  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  27.49 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>