More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50026 on replicon NC_011694
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011694  PHATRDRAFT_50026  predicted protein  100 
 
 		 741 aa  1507    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.301248  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0815  Na+/solute symporter  38.95 
 
 		 507 aa  131  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215377  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0093  Na+/solute symporter  40.53 
 
 		 505 aa  122  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.620511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0642  Na+/solute symporter  36.71 
 
 		 505 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0649  Na+/solute symporter  36.71 
 
 		 505 aa  115  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0662  Na+/solute symporter  36.71 
 
 		 505 aa  115  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  26.1 
 
 		 479 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  26.2 
 
 		 478 aa  99.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  25.79 
 
 		 479 aa  95.1  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  26.39 
 
 		 478 aa  94.7  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  35.9 
 
 		 471 aa  91.7  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  23.18 
 
 		 461 aa  87.8  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  24.64 
 
 		 482 aa  87  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  24.64 
 
 		 483 aa  86.7  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  34.54 
 
 		 515 aa  85.5  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  35.67 
 
 		 479 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  23.98 
 
 		 482 aa  82.4  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  22 
 
 		 461 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  23.73 
 
 		 461 aa  80.5  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  25 
 
 		 479 aa  79  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  33.89 
 
 		 476 aa  77.4  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  33.73 
 
 		 449 aa  75.5  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  31.58 
 
 		 472 aa  73.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  32.26 
 
 		 474 aa  73.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  32.8 
 
 		 495 aa  72.8  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  28.4 
 
 		 483 aa  72  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  29.55 
 
 		 492 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  28.98 
 
 		 486 aa  69.3  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1576  Sodium/proline symporter  30.3 
 
 		 499 aa  69.3  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84214  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  29.83 
 
 		 486 aa  68.2  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  28.72 
 
 		 498 aa  67  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  27.55 
 
 		 510 aa  67  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  29.29 
 
 		 499 aa  66.2  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  27.13 
 
 		 500 aa  65.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  28.65 
 
 		 498 aa  66.2  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6434  Na+/solute symporter  28.4 
 
 		 473 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  30.97 
 
 		 460 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0212  sodium/solute symporter  32.6 
 
 		 475 aa  65.1  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.200787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0563  Na+/solute symporter  30.72 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.379209 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  26.35 
 
 		 500 aa  64.3  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  27.23 
 
 		 592 aa  62.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  27.84 
 
 		 466 aa  62  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  31.77 
 
 		 460 aa  61.6  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  29.56 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  27.62 
 
 		 482 aa  61.2  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  26.71 
 
 		 462 aa  61.2  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  24 
 
 		 569 aa  60.8  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2382  Na+/solute symporter  29.89 
 
 		 528 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1134  Na+/solute symporter  21.29 
 
 		 527 aa  60.8  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  28.19 
 
 		 492 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  26.67 
 
 		 479 aa  60.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  25.79 
 
 		 524 aa  60.5  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2396  Na+/solute symporter  27.72 
 
 		 726 aa  60.1  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.79359 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  21.71 
 
 		 489 aa  59.3  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3039  Na+/solute symporter  27.17 
 
 		 703 aa  59.7  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  31.46 
 
 		 483 aa  59.7  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  30.1 
 
 		 488 aa  59.7  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  22.86 
 
 		 513 aa  60.1  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.63 
 
 		 613 aa  59.3  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0866  putative membrane transport protein  27.36 
 
 		 699 aa  59.3  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.201818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0645  Na+/solute symporter  26.49 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.646028  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5962  Na+/solute symporter  29.57 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2137  SSS sodium solute transporter superfamily  25.61 
 
 		 528 aa  58.9  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00565072  normal  0.610314 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  29.83 
 
 		 497 aa  59.3  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  29.57 
 
 		 483 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  25 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  24 
 
 		 560 aa  58.9  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  26.15 
 
 		 460 aa  58.5  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  27.72 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1533  Na+/solute symporter  26.98 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3539  Na+/solute symporter  25.95 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0326627  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  27.72 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6296  Na+/solute symporter  26.98 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957255  normal  0.770519 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6955  Na+/solute symporter  26.98 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.269545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  26.97 
 
 		 508 aa  58.5  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  24.34 
 
 		 566 aa  58.5  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2831  Na+/solute symporter  25.45 
 
 		 703 aa  58.2  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0688  Na+/solute symporter  25.77 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.217002  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  25.26 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  26.34 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  26.34 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  25.26 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  26.34 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  26.34 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  27.66 
 
 		 492 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  27.66 
 
 		 492 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1396  Na+/proline symporter  26.63 
 
 		 553 aa  56.6  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  27.13 
 
 		 492 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  29.03 
 
 		 483 aa  57  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05510  SSS sodium solute transporter  27.13 
 
 		 536 aa  56.6  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  24.74 
 
 		 527 aa  56.2  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  21.3 
 
 		 537 aa  56.2  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  30.34 
 
 		 483 aa  56.6  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  29.95 
 
 		 492 aa  56.6  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  22.41 
 
 		 565 aa  56.6  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  26.37 
 
 		 498 aa  56.2  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  23.76 
 
 		 482 aa  55.5  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3710  Na+/solute symporter  25.41 
 
 		 471 aa  55.8  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  28.49 
 
 		 483 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  27.04 
 
 		 507 aa  55.8  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>