23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50006 on replicon NC_011694
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011694  PHATRDRAFT_50006  predicted protein  100 
 
 
735 aa  1511    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3773  Phytochelatin synthase  32.19 
 
 
244 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2958  phytochelatin synthase  29.26 
 
 
239 aa  97.4  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0547  phytochelatin synthase, putative  28.7 
 
 
239 aa  97.8  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10791  putative phytochelatin synthase-like protein  30.97 
 
 
249 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2472  phytochelatin synthase-like  27.07 
 
 
247 aa  87.4  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2045  phytochelatin synthase, putative  33.77 
 
 
243 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000418313  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2416  putative phytochelatin synthase  33.5 
 
 
354 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0257304  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2472  putative phytochelatin synthase  33.5 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2036  putative phytochelatin synthase  33.5 
 
 
347 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.058145  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3276  putative phytochelatin synthase  34.92 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1307  putative phytochelatin synthase  34.92 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0059435  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2562  primitive phytochelatin synthase  34.92 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.957443  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1537  phytochelatin synthase, putative  34.92 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00496705  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1813  phytochelatin synthase-like protein  29.25 
 
 
269 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.542547  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1186  phytochelatin synthase-like protein  29.36 
 
 
266 aa  76.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5317  putative phytochelatin synthase  29.47 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0516  hypothetical protein  24.03 
 
 
319 aa  69.7  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.519264  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1278  putative phytochelatin synthase  49.15 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48175  predicted protein  26.29 
 
 
604 aa  65.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.696617  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1504  phytochelatin synthase  26.7 
 
 
247 aa  64.3  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298631  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9478  predicted protein  24.27 
 
 
227 aa  62.4  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2987  hypothetical protein  40.62 
 
 
218 aa  45.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.858708  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>