36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50002 on replicon NC_011694
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011694  PHATRDRAFT_50002  predicted protein  100 
 
 		 1122 aa  2332    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.736142  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49009  predicted protein  27.95 
 
 		 1039 aa  171  7e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43695  predicted protein  25.34 
 
 		 1060 aa  144  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.044454  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50515  predicted protein  25.85 
 
 		 1010 aa  137  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49258  predicted protein  25.86 
 
 		 1167 aa  130  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43471  predicted protein  25.17 
 
 		 785 aa  110  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49851  predicted protein  22.59 
 
 		 703 aa  105  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165107  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43645  predicted protein  23.39 
 
 		 862 aa  99.4  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0711576  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33231  predicted protein  21.79 
 
 		 918 aa  96.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47331  predicted protein  21.54 
 
 		 879 aa  94.7  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.217105  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34060  predicted protein  25.67 
 
 		 576 aa  93.6  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45435  predicted protein  23.38 
 
 		 784 aa  90.9  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.347089  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45520  predicted protein  23.47 
 
 		 860 aa  90.9  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.995437  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50061  predicted protein  20.81 
 
 		 886 aa  90.5  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.29853  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47265  predicted protein  23.04 
 
 		 709 aa  84  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.285264  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45879  predicted protein  21.48 
 
 		 1040 aa  78.2  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47986  predicted protein  21.18 
 
 		 712 aa  75.9  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49642  predicted protein  26.02 
 
 		 705 aa  75.1  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41008  predicted protein  23.1 
 
 		 823 aa  73.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45711  predicted protein  25.35 
 
 		 775 aa  62.8  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00177654  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43112  predicted protein  21.68 
 
 		 708 aa  62.4  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45149  predicted protein  21.12 
 
 		 537 aa  62  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54064  predicted protein  30.39 
 
 		 447 aa  62  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530235  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19174  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  23.94 
 
 		 629 aa  56.2  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_89032  predicted protein  23.94 
 
 		 683 aa  56.2  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.356102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47702  predicted protein  20.87 
 
 		 994 aa  53.5  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44671  predicted protein  25 
 
 		 428 aa  52  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364916  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50411  predicted protein  28.99 
 
 		 423 aa  51.6  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.918794  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42688  predicted protein  25.65 
 
 		 700 aa  49.7  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32043  predicted protein  22.32 
 
 		 889 aa  48.9  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485159  normal  0.0952764 
 
 
-
 
NC_003296  RS04706  putative PPR repeats containing protein  23.16 
 
 		 1373 aa  47.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.380322 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43575  predicted protein  22.7 
 
 		 737 aa  46.2  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.835069  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30981  predicted protein  23.15 
 
 		 439 aa  45.8  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116585  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31572  predicted protein  28.83 
 
 		 536 aa  45.8  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.314666  normal  0.270485 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29142  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  24.04 
 
 		 632 aa  45.8  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00572015  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2458  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  25.57 
 
 		 377 aa  45.4  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0995914 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>