170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49844 on replicon NC_011693
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_49844  predicted protein  100 
 
 
255 aa  526  1e-148  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.37 
 
 
213 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.55 
 
 
231 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
212 aa  89  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.52 
 
 
212 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0474  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.85 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000378302  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.63 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.44 
 
 
212 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.37 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  28.95 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  28.95 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  29.91 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0300  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.71 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.84 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  31.52 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.24 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  25 
 
 
227 aa  67  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  30.29 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32240  putative NADH-flavin reductase  27.65 
 
 
214 aa  65.1  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.778097  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  27.46 
 
 
212 aa  64.3  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.11 
 
 
218 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  30.94 
 
 
267 aa  64.3  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22130  putative NADH-flavin reductase  29.05 
 
 
221 aa  63.5  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  27.78 
 
 
215 aa  63.2  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22250  putative NADH-flavin reductase  28.48 
 
 
215 aa  63.2  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  30.3 
 
 
209 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  34.36 
 
 
374 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.83 
 
 
216 aa  59.7  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
218 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.06 
 
 
209 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  30.06 
 
 
209 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  30.06 
 
 
209 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0979  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.34 
 
 
211 aa  59.3  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 
209 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.63768  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  25.6 
 
 
218 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.88 
 
 
227 aa  58.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.09 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.09 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.09 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
209 aa  57.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 
219 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  27.98 
 
 
282 aa  56.2  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 
222 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297602  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.02 
 
 
328 aa  55.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.869195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  30.91 
 
 
216 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  26.47 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  25.62 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.4 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.29 
 
 
227 aa  53.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1374  hypothetical protein  26.38 
 
 
346 aa  53.1  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.920044  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49437  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases-like protein  26.35 
 
 
308 aa  52.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  25.32 
 
 
219 aa  52  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.84 
 
 
342 aa  52  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.88 
 
 
219 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.52 
 
 
209 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47367  predicted protein  26.29 
 
 
366 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389479  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  29.47 
 
 
290 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  29.47 
 
 
290 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 
219 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.68 
 
 
317 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205893  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  24.88 
 
 
209 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.89 
 
 
270 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.68 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 
324 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.88 
 
 
209 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0382  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.01 
 
 
229 aa  47.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.84 
 
 
320 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  24.66 
 
 
340 aa  47  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  26.32 
 
 
287 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  26.32 
 
 
287 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1606  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.81 
 
 
482 aa  46.6  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2079  NmrA family protein  31.36 
 
 
605 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.98 
 
 
225 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  26.83 
 
 
291 aa  46.6  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.91 
 
 
324 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02651  hypothetical protein  28.65 
 
 
481 aa  46.2  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  26.05 
 
 
231 aa  46.2  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.55 
 
 
228 aa  46.2  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  26.32 
 
 
287 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.12 
 
 
324 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 
298 aa  45.8  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.41 
 
 
218 aa  45.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  26.26 
 
 
221 aa  45.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.41 
 
 
352 aa  45.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
286 aa  45.8  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.12 
 
 
219 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
282 aa  45.4  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.12 
 
 
219 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.12 
 
 
219 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638466  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  26.4 
 
 
216 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 
293 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.29 
 
 
355 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>