34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49839 on replicon NC_011693
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_49839  predicted protein  100 
 
 		 1164 aa  2417    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  23.18 
 
 		 897 aa  59.7  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  23.57 
 
 		 1000 aa  59.7  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  21.48 
 
 		 1088 aa  58.5  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  21.61 
 
 		 740 aa  55.1  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  20.86 
 
 		 2145 aa  55.1  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  25.3 
 
 		 1146 aa  53.9  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  23.28 
 
 		 859 aa  52.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  24.04 
 
 		 992 aa  51.6  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  25.69 
 
 		 1136 aa  50.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  22.46 
 
 		 732 aa  51.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 949 aa  51.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  25.09 
 
 		 1509 aa  50.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  21.89 
 
 		 1131 aa  50.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  19.93 
 
 		 1039 aa  50.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  22.88 
 
 		 825 aa  49.7  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  20.43 
 
 		 1550 aa  48.9  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0229  TIR protein  25.97 
 
 		 965 aa  48.9  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105613  normal  0.178125 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  25.88 
 
 		 1288 aa  48.1  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  27.34 
 
 		 1326 aa  48.5  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  19.9 
 
 		 857 aa  47.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 1060 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.45 
 
 		 1424 aa  47.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  24.84 
 
 		 493 aa  47.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1404 aa  47.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02895  LipA and NB-ARC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G11500)  25.88 
 
 		 1478 aa  47  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.27 
 
 		 771 aa  46.2  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  24.18 
 
 		 1228 aa  45.8  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.74 
 
 		 991 aa  45.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 568 aa  45.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.34 
 
 		 568 aa  45.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  22.81 
 
 		 694 aa  45.1  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 843 aa  44.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  21.2 
 
 		 829 aa  44.7  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>