21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49748 on replicon NC_011692
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011692  PHATRDRAFT_49748  predicted protein  100 
 
 		 2821 aa  5747    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10734  translational activator, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07960)  32.55 
 
 		 2672 aa  647    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.257702 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02430  regulation of translational elongation-related protein, putative  36.57 
 
 		 2611 aa  670    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84618  GCN1; translational activator of GCN4  33.03 
 
 		 2721 aa  676    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_81  predicted protein  38.08 
 
 		 1330 aa  728    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.267422 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36160  predicted protein  30.8 
 
 		 995 aa  170  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02420  elongation factor 3  31.63 
 
 		 1055 aa  122  9e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.103235  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44942  predicted protein  28.31 
 
 		 556 aa  110  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90176  translation elongation factor  27.46 
 
 		 1048 aa  102  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.902447  normal  0.536047 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45865  predicted protein  32.13 
 
 		 923 aa  98.2  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.80899  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00950  mRNA export factor elf1, putative  27.09 
 
 		 1100 aa  97.1  5e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.484404  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89073  predicted protein  28.22 
 
 		 1031 aa  92  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161283  normal  0.722598 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27838  predicted protein  29.36 
 
 		 1040 aa  90.5  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88728  predicted protein  23.51 
 
 		 1141 aa  73.6  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.690875  normal  0.12515 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  25.57 
 
 		 1328 aa  68.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  25.36 
 
 		 838 aa  66.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06700  elongation factor 3 (Eurofung)  26.56 
 
 		 917 aa  65.9  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.617822 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06651  mRNA-nucleus export ATPase (Elf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03580)  24.85 
 
 		 1118 aa  63.9  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1094 aa  60.5  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  23.28 
 
 		 1148 aa  52  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1224 aa  48.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>