More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49608 on replicon NC_011691
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011691  PHATRDRAFT_49608  FeS assembly protein suf  100 
 
 		 690 aa  1425    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  29.13 
 
 		 440 aa  150  6e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3353  FeS assembly protein SufD  31.33 
 
 		 439 aa  142  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  27.33 
 
 		 442 aa  137  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  25.87 
 
 		 446 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  31.38 
 
 		 437 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  31.38 
 
 		 437 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3443  FeS assembly protein SufD  26.8 
 
 		 451 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  hitchhiker  0.0000000788125 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  31.38 
 
 		 439 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  32.54 
 
 		 425 aa  132  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2838  FeS assembly protein SufD  36.02 
 
 		 459 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4357  FeS assembly protein SufD  26.19 
 
 		 453 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0670  SufBD  39.9 
 
 		 242 aa  128  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.351834 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  40 
 
 		 430 aa  128  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  29.43 
 
 		 437 aa  127  7e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1897  FeS assembly protein SufD  43.2 
 
 		 454 aa  125  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  33.67 
 
 		 445 aa  124  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0417  FeS assembly protein SufD  31.49 
 
 		 455 aa  123  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0428  FeS assembly protein SufD  31.49 
 
 		 455 aa  123  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  36.69 
 
 		 437 aa  124  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10147  ABC(membrane) family transporter (Fe-S assembly/SufBCD system)  32.05 
 
 		 383 aa  123  9e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0858982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  30.48 
 
 		 438 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  31.96 
 
 		 445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  26.79 
 
 		 467 aa  122  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1737  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  44.17 
 
 		 442 aa  122  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  34.21 
 
 		 447 aa  122  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  25.87 
 
 		 444 aa  122  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2438  transport system  40.46 
 
 		 424 aa  121  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.629208  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1237  FeS assembly protein SufD  31.79 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  40 
 
 		 439 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0812  FeS assembly protein SufD  36.47 
 
 		 421 aa  119  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0156327  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  27.5 
 
 		 454 aa  118  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  37.88 
 
 		 426 aa  118  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2104  FeS assembly protein SufD  35.19 
 
 		 424 aa  117  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111297 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0086  FeS assembly protein SufD  28.7 
 
 		 446 aa  117  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902249  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  40.11 
 
 		 399 aa  117  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1897  FeS assembly protein SufD  34.04 
 
 		 424 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363376 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1466  FeS assembly protein SufD  40 
 
 		 425 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269271  normal  0.0505489 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  24.95 
 
 		 475 aa  116  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5929  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  37.82 
 
 		 441 aa  115  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1779  FeS assembly protein SufD  39.31 
 
 		 422 aa  114  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.377637  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0798  FeS assembly protein SufD  29.35 
 
 		 448 aa  114  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  27.51 
 
 		 445 aa  114  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5846  FeS assembly protein SufD  35.27 
 
 		 439 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798373  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  38.73 
 
 		 441 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000908978 
 
 
-
 
NC_002950  PG0259  hypothetical protein  42.34 
 
 		 447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  40.25 
 
 		 446 aa  112  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  30.68 
 
 		 447 aa  112  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  37.65 
 
 		 436 aa  112  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  26.9 
 
 		 441 aa  111  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4731  FeS assembly protein SufD  28.78 
 
 		 454 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3968  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  40.4 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  36.42 
 
 		 428 aa  109  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  33.77 
 
 		 428 aa  109  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0406  ABC transporter, membrane component  45.38 
 
 		 397 aa  108  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.449797  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  33.68 
 
 		 439 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  34.07 
 
 		 448 aa  108  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  36.42 
 
 		 428 aa  108  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1662  FeS assembly protein SufD  34.65 
 
 		 440 aa  107  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0198  SufBD  39.39 
 
 		 244 aa  107  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  38.36 
 
 		 441 aa  108  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3260  FeS assembly protein SufD  39.88 
 
 		 437 aa  108  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854773 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2447  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  33.33 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0918237  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3979  FeS assembly protein SufD  38.12 
 
 		 440 aa  107  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.557806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2253  FeS assembly protein SufD  42.19 
 
 		 425 aa  107  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4347  FeS assembly protein SufD  38.12 
 
 		 440 aa  107  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.964279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2744  FeS assembly protein SufD  37.43 
 
 		 437 aa  107  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0927  FeS assembly protein SufD  41.41 
 
 		 425 aa  107  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0933  hypothetical protein  41.41 
 
 		 425 aa  107  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.478935  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2592  SufBD protein  36.17 
 
 		 343 aa  106  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.956009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2182  FeS assembly protein SufD  32.67 
 
 		 430 aa  107  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00372384  hitchhiker  0.000585375 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4459  FeS assembly protein SufD  41.33 
 
 		 440 aa  106  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.2712 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  27.91 
 
 		 453 aa  106  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  37.27 
 
 		 444 aa  105  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  35.16 
 
 		 426 aa  104  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  29.74 
 
 		 450 aa  105  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2458  FeS assembly protein SufD  38.51 
 
 		 437 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.833793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  35.16 
 
 		 426 aa  104  5e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  41.01 
 
 		 437 aa  104  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1763  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.16 
 
 		 423 aa  104  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.182167  hitchhiker  0.0000315224 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03041  ABC transporter, membrane component  39.74 
 
 		 416 aa  103  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  29.33 
 
 		 420 aa  103  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5107  FeS assembly protein SufD  31.39 
 
 		 439 aa  103  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0193182 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1697  FeS assembly protein SufD  35.48 
 
 		 430 aa  103  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294615  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1961  FeS assembly protein SufD  31.9 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0846147  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1469  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.32 
 
 		 423 aa  103  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.866432  normal  0.0690013 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  36.65 
 
 		 439 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1799  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.32 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.024835  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1515  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.9 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.252227  hitchhiker  0.00000429728 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1485  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.32 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000206713 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2395  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.9 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.087197  hitchhiker  0.000115041 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0100  FeS assembly protein SufD  34.94 
 
 		 444 aa  102  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.993052 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1897  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.9 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00143509  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01650  component of SufBCD complex  31.9 
 
 		 423 aa  102  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0990  FeS assembly protein SufD  38.89 
 
 		 434 aa  102  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1950  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.9 
 
 		 423 aa  102  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0520002  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1762  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.9 
 
 		 423 aa  102  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0210181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01640  hypothetical protein  31.9 
 
 		 423 aa  102  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000779694  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2591  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  33.51 
 
 		 441 aa  102  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00801  ABC transporter, membrane component  35.42 
 
 		 405 aa  101  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>