13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49568 on replicon NC_011691
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011691  PHATRDRAFT_49568  predicted protein  100 
 
 
605 aa  1241    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.110101  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04477  amino acid transporter (Eurofung)  28.7 
 
 
739 aa  143  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81023  predicted protein  25.57 
 
 
670 aa  142  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND06100  conserved hypothetical protein  27.51 
 
 
819 aa  127  5e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0680473  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07777  amino acid transporter (Eurofung)  25.11 
 
 
580 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.14577  normal  0.468629 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_40517  predicted protein  25.33 
 
 
501 aa  110  9.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.299005  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_87014  predicted protein  23.81 
 
 
621 aa  97.1  9e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.728691  normal  0.601954 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45824  predicted protein  22.83 
 
 
580 aa  59.7  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122291  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39978  predicted protein  23.94 
 
 
688 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45709  predicted protein  19.45 
 
 
472 aa  46.6  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.000165254  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45260  predicted protein  20.32 
 
 
594 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45969  predicted protein  25 
 
 
509 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57811  predicted protein  21.22 
 
 
424 aa  43.9  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00397212  normal  0.0130969 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>