16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49556 on replicon NC_011691
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011691  PHATRDRAFT_49556  predicted protein  100 
 
 
541 aa  1107    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_93465  predicted protein  31.64 
 
 
278 aa  97.8  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00870525 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44877  predicted protein  23.97 
 
 
476 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5884  hypothetical protein  30.63 
 
 
376 aa  48.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0216  hypothetical protein  28.93 
 
 
411 aa  47.8  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.380044  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50474  predicted protein  31.9 
 
 
747 aa  47  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0241823  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0378  hypothetical protein  32.14 
 
 
401 aa  47  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2392  hypothetical protein  28.98 
 
 
423 aa  46.6  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87131  predicted protein  30.39 
 
 
453 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00012796  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1208  hypothetical protein  24.85 
 
 
273 aa  44.7  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0449  hypothetical protein  30.43 
 
 
392 aa  45.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114768  decreased coverage  0.00000434601 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47613  predicted protein  27.67 
 
 
601 aa  44.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1304  hypothetical protein  26.72 
 
 
388 aa  43.9  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00427648  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1122  hypothetical protein  26.72 
 
 
388 aa  43.5  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.003942  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0312  hypothetical protein  30.07 
 
 
388 aa  43.5  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0938935  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1010  hypothetical protein  22.52 
 
 
420 aa  43.5  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.75207  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>