69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49156 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_49156  predicted protein  100 
 
 
1086 aa  2270    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.402458  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.92 
 
 
1797 aa  193  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.13 
 
 
1804 aa  187  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  22.79 
 
 
1112 aa  187  1.0000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  22.13 
 
 
2077 aa  179  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.98 
 
 
1795 aa  177  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  21.65 
 
 
1850 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.35 
 
 
1942 aa  173  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  23.16 
 
 
1064 aa  172  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  22.38 
 
 
1934 aa  169  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50616  predicted protein  26.24 
 
 
1015 aa  165  5.0000000000000005e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00719688  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  21.44 
 
 
1908 aa  164  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  24.08 
 
 
1060 aa  164  8.000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  20.98 
 
 
1808 aa  159  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  23.39 
 
 
2051 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  21.72 
 
 
1780 aa  155  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.35 
 
 
1794 aa  154  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.72 
 
 
1901 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  21.37 
 
 
2361 aa  149  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  23.21 
 
 
1697 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  22.36 
 
 
1644 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  20.39 
 
 
1774 aa  146  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  22.09 
 
 
1871 aa  145  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  21.73 
 
 
1833 aa  140  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50602  predicted protein  24.2 
 
 
1255 aa  139  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94407  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  22.34 
 
 
1805 aa  139  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  21.36 
 
 
1780 aa  138  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  20.62 
 
 
1123 aa  135  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  22.36 
 
 
1123 aa  132  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  22.53 
 
 
1811 aa  130  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  21.88 
 
 
1932 aa  129  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  21.48 
 
 
1922 aa  129  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  20.95 
 
 
1809 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.04 
 
 
1805 aa  123  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  21.8 
 
 
1845 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54547  protein kinase  20.54 
 
 
900 aa  118  6.9999999999999995e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  22.12 
 
 
1739 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  21.46 
 
 
2272 aa  113  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  22.27 
 
 
1473 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  22.27 
 
 
1473 aa  112  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  22.27 
 
 
1473 aa  112  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  21.33 
 
 
2279 aa  112  4.0000000000000004e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  23.52 
 
 
2109 aa  111  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  21.59 
 
 
1668 aa  109  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.06 
 
 
1822 aa  108  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  21.68 
 
 
1712 aa  107  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  21.23 
 
 
1663 aa  106  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  19.94 
 
 
1914 aa  106  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  21.84 
 
 
2017 aa  103  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  21.17 
 
 
2303 aa  97.8  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  20.48 
 
 
1836 aa  91.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  22.85 
 
 
1797 aa  90.9  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  21.11 
 
 
1885 aa  80.9  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  23.91 
 
 
1832 aa  79  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  22.34 
 
 
1837 aa  78.6  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50617  predicted protein  26.03 
 
 
859 aa  72.4  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00889588  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  21.32 
 
 
1885 aa  67  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  21.23 
 
 
1685 aa  55.1  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  22.81 
 
 
1788 aa  55.1  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  23.17 
 
 
1685 aa  54.3  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  22.49 
 
 
1685 aa  52.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  23.64 
 
 
670 aa  53.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  21.32 
 
 
1748 aa  52  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4074  serine/threonine protein kinase  26.96 
 
 
1297 aa  50.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0173368 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  21.63 
 
 
1756 aa  49.3  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1593  serine/threonine protein kinase  21.36 
 
 
1377 aa  47.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  25.35 
 
 
723 aa  45.8  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5633  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  22.32 
 
 
1131 aa  45.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  24.72 
 
 
1013 aa  44.7  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>