14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49130 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_49130  predicted protein  100 
 
 
472 aa  994    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44250  predicted protein  34.94 
 
 
871 aa  268  1e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48279  predicted protein  33.33 
 
 
839 aa  263  4e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48287  predicted protein  33.33 
 
 
839 aa  263  4e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323261  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0541  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
416 aa  52  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2772  hypothetical protein  28.44 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.225588  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2129  hypothetical protein  31.82 
 
 
289 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3473  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
281 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1056  hypothetical protein  26.83 
 
 
416 aa  48.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496515  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5022  hypothetical protein  28.17 
 
 
304 aa  47.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.841987 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3923  protein of unknown function DUF23  30 
 
 
286 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1773  hypothetical protein  26.56 
 
 
787 aa  46.6  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.488982 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4855  hypothetical protein  29.9 
 
 
349 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4517  hypothetical protein  31.25 
 
 
461 aa  43.9  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>